186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2073 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 517 aa  957    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  37.61 
 
 		 543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  37.96 
 
 		 501 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  39.52 
 
 		 505 aa  95.9  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  34.66 
 
 		 514 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  34.85 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 552 aa  74.3  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  41.77 
 
 		 561 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  38.2 
 
 		 520 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  36.88 
 
 		 515 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  30.47 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  38.22 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  28.12 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  28.12 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  29.69 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  28.91 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  27.34 
 
 		 371 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  26.56 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  26.56 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  26.56 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  36.54 
 
 		 528 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  26.56 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  41.3 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 659 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  47.22 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  34.52 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.04 
 
 		 601 aa  57.4  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  23.53 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  50.82 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  38.1 
 
 		 525 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  36.9 
 
 		 525 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  42.37 
 
 		 399 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  45.88 
 
 		 645 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 705 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1140  transcriptional regulator, CdaR  34.92 
 
 		 377 aa  55.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000252697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  31.07 
 
 		 412 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.07 
 
 		 412 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  28.68 
 
 		 518 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  41.25 
 
 		 619 aa  54.3  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 558 aa  54.3  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 412 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 381 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  34.82 
 
 		 598 aa  54.3  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2592  carbohydrate diacid regulator (sugar diacid regulator)  30.77 
 
 		 381 aa  53.9  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  39.24 
 
 		 627 aa  53.9  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  44.62 
 
 		 431 aa  53.9  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2687  transcriptional regulator, CdaR  35.06 
 
 		 387 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  35.06 
 
 		 387 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  35.06 
 
 		 387 aa  53.9  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  35.06 
 
 		 393 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  36.84 
 
 		 648 aa  53.5  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  45.57 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  36.62 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  22.94 
 
 		 353 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03504  sugar diacide regulator  40.3 
 
 		 168 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 637 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 494 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2578  transcriptional regulator, CdaR  39.74 
 
 		 326 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 553 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  42.67 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  41.27 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  32.39 
 
 		 404 aa  52  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  34.82 
 
 		 486 aa  51.2  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  35.43 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  42.47 
 
 		 374 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  24.7 
 
 		 739 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 549 aa  50.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.33 
 
 		 459 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 312 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  38.37 
 
 		 492 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  34.86 
 
 		 400 aa  50.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  42.47 
 
 		 387 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 537 aa  50.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3621  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  37.88 
 
 		 384 aa  50.4  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  37.7 
 
 		 512 aa  50.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  43.42 
 
 		 538 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  31.25 
 
 		 602 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  43.1 
 
 		 515 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  50.82 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  37.39 
 
 		 483 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  25.68 
 
 		 493 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4083  putative carbohydrate diacid regulator  27.12 
 
 		 375 aa  50.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.329455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  45.76 
 
 		 373 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.54 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0113  transcriptional regulator, CdaR  27.12 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  35.58 
 
 		 558 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 553 aa  48.5  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  32.67 
 
 		 478 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  37.84 
 
 		 384 aa  48.5  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4050  putative carbohydrate diacid regulator  27.12 
 
 		 375 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 582 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  39.74 
 
 		 393 aa  48.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  27.91 
 
 		 362 aa  48.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  45.28 
 
 		 377 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2100  fis-type helix-turn-helix domain protein  26.76 
 
 		 287 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147633  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  27 
 
 		 364 aa  48.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>