229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2290 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 403 aa  769    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  52.01 
 
 		 402 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  38.57 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  34.75 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  34.77 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  37.09 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  33.59 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3802  putative transcriptional regulator, PucR family  27.72 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  22.98 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  20.43 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4484  putative transcriptional regulator, PucR family  33.58 
 
 		 365 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.402234  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  28 
 
 		 537 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  31.11 
 
 		 514 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  21.76 
 
 		 555 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  29.72 
 
 		 529 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  27.78 
 
 		 511 aa  67  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  32.9 
 
 		 558 aa  67  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4011  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 406 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  31.07 
 
 		 522 aa  67  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  29.01 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  28.06 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  40.74 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  30.19 
 
 		 547 aa  62.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  31.33 
 
 		 518 aa  63.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 648 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 564 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  28.48 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1109  putative transcriptional regulator, PucR family  26.9 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  30.34 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  27.78 
 
 		 740 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.01 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  35.95 
 
 		 525 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  33.82 
 
 		 609 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  28.5 
 
 		 538 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  31.79 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  31.79 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  31.79 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  31.79 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.79 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.79 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  23.57 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  31.79 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  33.53 
 
 		 525 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  44.09 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 563 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  29.78 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  30.95 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  24.69 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  29.9 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  29.9 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.84 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  28.43 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  29.9 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  28.09 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.09 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  30.08 
 
 		 530 aa  57  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 524 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  31.03 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  28.09 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  28.09 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.09 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.09 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  27.47 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.09 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  19.75 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  27.61 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1496  putative transcriptional regulator, PucR family  35.95 
 
 		 502 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  48.33 
 
 		 519 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  34.87 
 
 		 530 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  26.73 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  26.73 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  26.73 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  26.73 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  26.73 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  41.94 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  25.93 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2528  transcriptional regulator, CdaR  45.45 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0789  putative transcriptional regulator, PucR family  19.72 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.691092  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  25.41 
 
 		 600 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  40.74 
 
 		 627 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  22.32 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  21.85 
 
 		 537 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  48.44 
 
 		 543 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  31.88 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  23.97 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  38.36 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  30.52 
 
 		 665 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  29.39 
 
 		 514 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  29.55 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  38.61 
 
 		 562 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  33.86 
 
 		 637 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>