160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0117 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 411 aa  819    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  41.01 
 
 		 387 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  38.18 
 
 		 418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  41.42 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  37.87 
 
 		 431 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  37.02 
 
 		 377 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  28.46 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  37.89 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  43.24 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2578  transcriptional regulator, CdaR  38.14 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  44.05 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  32.86 
 
 		 553 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  25.59 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  26.09 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  28.82 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.12 
 
 		 492 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  38.67 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  45.95 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  38.46 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  29.12 
 
 		 502 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3621  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  43.24 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.12 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 616 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  44.07 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  41.94 
 
 		 353 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  41.94 
 
 		 353 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 462 aa  53.5  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0150  transcriptional regulator, CdaR  44.83 
 
 		 384 aa  53.5  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  44.05 
 
 		 478 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  50.77 
 
 		 420 aa  53.1  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2857  putative transcriptional regulator, PucR family  28.88 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  44.62 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  48.33 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  25.73 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  46.88 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  31.13 
 
 		 741 aa  52.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  41.89 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 564 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.42 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  43.24 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  40.54 
 
 		 418 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  43.24 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  35.43 
 
 		 517 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  27.61 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  34.91 
 
 		 416 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  43.75 
 
 		 473 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 408 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50790  hypothetical protein  44.44 
 
 		 370 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937212  hitchhiker  0.00694417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  43.24 
 
 		 428 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2673  transcriptional regulator, CdaR  42.25 
 
 		 365 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0615728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43380  carbohydrate diacid transcriptional regulator  34 
 
 		 367 aa  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251481  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  31.29 
 
 		 418 aa  49.7  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.42 
 
 		 385 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.42 
 
 		 385 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  42.42 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  42.42 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  24.7 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2909  CdaR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 553 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  45.61 
 
 		 554 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  24.75 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.42 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.42 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.42 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.42 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.42 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.42 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.42 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.42 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  42.42 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  42.65 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3281  carbohydrate diacid regulator, putative  37.18 
 
 		 363 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  26.72 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  47.37 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  47.37 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  46.55 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  21.69 
 
 		 350 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  42.37 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  42.37 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  40.68 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 371 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  40.68 
 
 		 371 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  40.68 
 
 		 371 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 371 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  41.67 
 
 		 429 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  51.92 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  42.37 
 
 		 371 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  40.68 
 
 		 371 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  40.68 
 
 		 371 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3116  putative sugar diacid recognition  39.02 
 
 		 363 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  25.59 
 
 		 405 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>