96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0393 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 418 aa  838    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  52.05 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  39.1 
 
 		 431 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  38.18 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  40.25 
 
 		 395 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  35.49 
 
 		 377 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  40.86 
 
 		 553 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  33.13 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2578  transcriptional regulator, CdaR  43.62 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  36.03 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  25.16 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 552 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  38.14 
 
 		 611 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  40.51 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  44.64 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  35.56 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  35.11 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  33 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  30.95 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  39.8 
 
 		 429 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  33.33 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  35.96 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  58.14 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  49.18 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  41.58 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  45.31 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  32.14 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  30.95 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  30.95 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  44.93 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  27.44 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  30.95 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  30.95 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 390 aa  50.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  40.68 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 410 aa  49.7  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  50.98 
 
 		 408 aa  49.7  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  43.33 
 
 		 428 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  43.33 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  30.95 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  35.9 
 
 		 528 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 312 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  42.62 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  32.28 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  42.17 
 
 		 537 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  44.83 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  44.83 
 
 		 365 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  44.26 
 
 		 540 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  33.09 
 
 		 416 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13710  sugar diacid utilization regulator  36.11 
 
 		 393 aa  47  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 436 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  53.49 
 
 		 373 aa  46.6  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  51.16 
 
 		 394 aa  46.6  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  33.6 
 
 		 616 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  43.1 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  37.14 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  28.47 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  43.1 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  43.1 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  45.28 
 
 		 374 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  24.68 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  51.16 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  38.46 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  38.46 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2687  transcriptional regulator, CdaR  38.46 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  38.46 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  27.14 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7392  putative transcriptional regulator, PucR family  26.84 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  36.99 
 
 		 525 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  27.92 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  47.73 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  46.43 
 
 		 529 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2857  putative transcriptional regulator, PucR family  40.3 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  51.16 
 
 		 487 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 532 aa  43.9  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1140  transcriptional regulator, CdaR  46.51 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000252697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27560  regulatory helix-turn-helix protein, lysR family  42.11 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.144166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0676  hypothetical protein  35.78 
 
 		 170 aa  43.9  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.60111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  36.25 
 
 		 525 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  45 
 
 		 501 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  28.86 
 
 		 434 aa  43.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  37.04 
 
 		 525 aa  43.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 408 aa  43.5  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  26.03 
 
 		 381 aa  43.1  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.75 
 
 		 445 aa  43.1  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 403 aa  43.1  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>