144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4288 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 387 aa  766    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  52.05 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  41.01 
 
 		 411 aa  250  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  41.21 
 
 		 431 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  43.68 
 
 		 395 aa  229  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  38.62 
 
 		 377 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2578  transcriptional regulator, CdaR  28.41 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  28.25 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  43.96 
 
 		 553 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  28.61 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  36.31 
 
 		 512 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  35.4 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  56 
 
 		 611 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  23.11 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 312 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  22.67 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  27.32 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  29.05 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  49.28 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  54.39 
 
 		 616 aa  56.6  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  43.42 
 
 		 528 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 421 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  34.29 
 
 		 614 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  23.29 
 
 		 371 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  23.29 
 
 		 371 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  23.29 
 
 		 371 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  43.21 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  23.29 
 
 		 371 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  36.36 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  54.72 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  46.15 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  32.74 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  50 
 
 		 408 aa  53.1  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 479 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  36.36 
 
 		 371 aa  53.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  36.36 
 
 		 371 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  29.3 
 
 		 414 aa  52.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  48.33 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  35.29 
 
 		 501 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  26.52 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  26.92 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  48.28 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  23.11 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  42.47 
 
 		 517 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  41.27 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  29.22 
 
 		 665 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  28.99 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27560  regulatory helix-turn-helix protein, lysR family  50 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.144166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  46.77 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  25.9 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  42.42 
 
 		 276 aa  50.8  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  26.91 
 
 		 473 aa  50.4  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  54.35 
 
 		 539 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  31.18 
 
 		 353 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  26.38 
 
 		 434 aa  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  27 
 
 		 408 aa  49.7  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13710  sugar diacid utilization regulator  38.33 
 
 		 393 aa  49.7  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  37.5 
 
 		 353 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  34.59 
 
 		 554 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  31.55 
 
 		 637 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  46.03 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  40.51 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  34.59 
 
 		 554 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  34.59 
 
 		 554 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  34.88 
 
 		 498 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  40.79 
 
 		 647 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  48.28 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.51 
 
 		 480 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1836  CdaR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  48.28 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  48.28 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  48.94 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  48.94 
 
 		 486 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  41.43 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  46.77 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  50.82 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  49.02 
 
 		 540 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  54.35 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  49.15 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2531  hypothetical protein  23.85 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  26.87 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  39.06 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 552 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 537 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  37.14 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  31 
 
 		 411 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  24.07 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  40.18 
 
 		 425 aa  47  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 514 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  25.29 
 
 		 422 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 403 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  47.17 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>