34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4395 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 403 aa  801    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1836  CdaR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  26.5 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 462 aa  63.2  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  26.33 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  26.88 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  29.56 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  26.93 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  28.42 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  25.59 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 379 aa  53.9  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  26.54 
 
 		 406 aa  53.5  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1016  putative transcriptional regulator, PucR family  27.03 
 
 		 382 aa  53.1  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13413  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3307  hypothetical protein  35.19 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.468406  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  31.78 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  25.9 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  28.05 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  40 
 
 		 413 aa  49.7  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  26.93 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  27.41 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  29.34 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  25.71 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  26.5 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  41.67 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  30.13 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  47.73 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  42 
 
 		 408 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  44.19 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  30.67 
 
 		 388 aa  43.5  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  27.43 
 
 		 276 aa  43.1  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  46.51 
 
 		 421 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  32.26 
 
 		 359 aa  42.7  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>