25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1016 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1016  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 382 aa  750    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13413  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 462 aa  133  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  35.22 
 
 		 389 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2662  putative transcriptional regulator, PucR family  27.89 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  27.49 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  28.84 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  28.53 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  26.89 
 
 		 418 aa  57  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 408 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  31.92 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  27.03 
 
 		 403 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27560  regulatory helix-turn-helix protein, lysR family  54.17 
 
 		 413 aa  53.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.144166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 518 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 393 aa  47  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  42.65 
 
 		 558 aa  47  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  28.57 
 
 		 420 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  27.48 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  35.23 
 
 		 681 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 552 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1640  putative transcriptional regulator  56.82 
 
 		 488 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0175  carbohydrate diacid regulator  56.82 
 
 		 488 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0265  putative carbohydrate diacid regulator  56.82 
 
 		 483 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18471  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0203  carbohydrate diacid regulator  56.82 
 
 		 402 aa  42.7  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>