159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3217 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 431 aa  838    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  51.36 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  39.1 
 
 		 418 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  41.21 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  37.87 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  37.56 
 
 		 377 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  26.4 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4395  transcriptional regulator, CdaR  26.15 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  27.01 
 
 		 418 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  36.62 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  36.62 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  28.12 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 371 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  35.21 
 
 		 371 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  35.21 
 
 		 371 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 371 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  35.21 
 
 		 371 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  53.45 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  55.17 
 
 		 553 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  35.82 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  35.82 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  39.68 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  39.68 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  44.74 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  45.45 
 
 		 517 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  44.78 
 
 		 616 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  35.82 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  42.11 
 
 		 386 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1836  CdaR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 384 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2578  transcriptional regulator, CdaR  36.28 
 
 		 326 aa  53.5  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  52.94 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  54.35 
 
 		 408 aa  53.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  27.87 
 
 		 558 aa  53.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  55.81 
 
 		 394 aa  53.1  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  36.59 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  52.17 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  32.56 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3621  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  44.07 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  48.28 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  27.65 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  35.38 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 515 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  59.09 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  46.15 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3116  putative sugar diacid recognition  28.57 
 
 		 363 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  42.03 
 
 		 487 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 514 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  54.76 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  34.72 
 
 		 528 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  40 
 
 		 516 aa  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  53.85 
 
 		 512 aa  49.7  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 564 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  46.27 
 
 		 480 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  43.55 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0150  transcriptional regulator, CdaR  47.06 
 
 		 384 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  43.86 
 
 		 741 aa  49.7  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  46.55 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1140  transcriptional regulator, CdaR  35.37 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000252697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  43.94 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  53.06 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  29.4 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 384 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  35.16 
 
 		 554 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50790  hypothetical protein  31.34 
 
 		 370 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937212  hitchhiker  0.00694417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  35.16 
 
 		 554 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  35.16 
 
 		 554 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  44.9 
 
 		 511 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  53.49 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  44.62 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  43.86 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2592  carbohydrate diacid regulator (sugar diacid regulator)  38.46 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3281  carbohydrate diacid regulator, putative  37.5 
 
 		 363 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 372 aa  47.4  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  29.26 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  29.5 
 
 		 385 aa  47  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  60.98 
 
 		 420 aa  47  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  51.22 
 
 		 418 aa  47  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  52.08 
 
 		 538 aa  47  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  40 
 
 		 376 aa  47  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.5 
 
 		 385 aa  47  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  29.5 
 
 		 385 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  37.84 
 
 		 328 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.5 
 
 		 385 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.5 
 
 		 385 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  34.78 
 
 		 436 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  29.5 
 
 		 385 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  30.88 
 
 		 385 aa  46.6  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 553 aa  46.6  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>