180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5870 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 402 aa  802    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  60.8 
 
 		 410 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  52.01 
 
 		 408 aa  352  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  52.2 
 
 		 404 aa  336  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  37.72 
 
 		 406 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  35.13 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  32.73 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 408 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  31.3 
 
 		 399 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  31.27 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  33.66 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  29.64 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  34.37 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  30.06 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  27.15 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  27.14 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  27.73 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  40.51 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  26.3 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2412  hypothetical protein  38.52 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  45 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  47.46 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  47.22 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  46.15 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  47.46 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  47.46 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  46.27 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  31.5 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  43.42 
 
 		 528 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  54.84 
 
 		 501 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  47.14 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  40.7 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  22.74 
 
 		 562 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  39.53 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  40.45 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  33.58 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 558 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  30.3 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  45.76 
 
 		 428 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  45.76 
 
 		 428 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  45.76 
 
 		 428 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  39.24 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  39.24 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  39.76 
 
 		 495 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  39.24 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  39.24 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  39.24 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  39.24 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  35.26 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  39.24 
 
 		 410 aa  53.1  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  38.71 
 
 		 416 aa  53.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  34 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2662  putative transcriptional regulator, PucR family  27.51 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  34.84 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  40.59 
 
 		 681 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  38.54 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  30.89 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 516 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  49.3 
 
 		 514 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  48.39 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  48.08 
 
 		 554 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 429 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  48.08 
 
 		 554 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  48.08 
 
 		 554 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  50 
 
 		 511 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2110  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  49.06 
 
 		 529 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  36.9 
 
 		 609 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  56.1 
 
 		 473 aa  50.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  39.76 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  46.43 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 425 aa  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  52.08 
 
 		 429 aa  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13710  sugar diacid utilization regulator  32.65 
 
 		 393 aa  50.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  55.81 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  30.6 
 
 		 515 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  31.76 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  41.03 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  26.2 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  39.29 
 
 		 458 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  44.26 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  52 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  52 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  48.21 
 
 		 525 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  52 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  56.1 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  28.57 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  51.06 
 
 		 514 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  45.76 
 
 		 543 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0150  transcriptional regulator, CdaR  43.21 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  26.98 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  58.54 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  53.66 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  27.22 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>