192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2630 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 
528 aa  1007    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.25 
 
 
501 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
537 aa  87.4  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  26.65 
 
 
520 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  26.01 
 
 
538 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  31.67 
 
 
519 aa  76.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  30.54 
 
 
558 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  31.05 
 
 
483 aa  71.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
516 aa  70.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.2 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  21.31 
 
 
515 aa  68.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.59 
 
 
480 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  30.65 
 
 
493 aa  67.8  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  29.25 
 
 
365 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  44.44 
 
 
377 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  25.57 
 
 
502 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
312 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  37.19 
 
 
558 aa  64.3  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  36.92 
 
 
609 aa  63.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  25.46 
 
 
512 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 
399 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  19.66 
 
 
542 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  26.78 
 
 
487 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
305 aa  60.1  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  26.27 
 
 
535 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  29.51 
 
 
598 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  32.62 
 
 
405 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  28.6 
 
 
510 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.1 
 
 
492 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.1 
 
 
492 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  32.33 
 
 
376 aa  58.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  25.33 
 
 
486 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  33.51 
 
 
400 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
381 aa  57  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  57.78 
 
 
561 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  38.46 
 
 
406 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  43.42 
 
 
387 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  26.18 
 
 
515 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  35.21 
 
 
410 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  30.37 
 
 
739 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  25.55 
 
 
364 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
514 aa  56.2  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  26.52 
 
 
539 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  30.04 
 
 
485 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  30.37 
 
 
543 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
552 aa  54.7  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  32.19 
 
 
407 aa  54.7  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
403 aa  53.9  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
408 aa  53.9  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  18.42 
 
 
562 aa  53.9  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
563 aa  53.5  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  38.98 
 
 
525 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  31.88 
 
 
380 aa  53.5  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  34.46 
 
 
425 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  47.37 
 
 
404 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  31.82 
 
 
371 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  41.54 
 
 
416 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  34.23 
 
 
371 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  34.23 
 
 
371 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  34.23 
 
 
371 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  40.54 
 
 
501 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  24.03 
 
 
359 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  39.06 
 
 
524 aa  52.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  47.37 
 
 
414 aa  52.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  36.54 
 
 
517 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  31.82 
 
 
371 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  34.23 
 
 
371 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  33.33 
 
 
371 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  24 
 
 
429 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 
447 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  47.37 
 
 
543 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  24 
 
 
429 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  41.67 
 
 
392 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
517 aa  52  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  24 
 
 
429 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  30.36 
 
 
415 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  48.57 
 
 
400 aa  52  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  30.51 
 
 
486 aa  51.2  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  32.89 
 
 
438 aa  51.2  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  46.94 
 
 
374 aa  51.6  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  28.91 
 
 
412 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.67 
 
 
445 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.91 
 
 
412 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2578  transcriptional regulator, CdaR  35.42 
 
 
326 aa  50.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
412 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  43.08 
 
 
420 aa  50.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  36 
 
 
379 aa  50.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  40.26 
 
 
554 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  40.26 
 
 
554 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  40.26 
 
 
554 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  37.29 
 
 
525 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  30.82 
 
 
481 aa  50.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  25.17 
 
 
504 aa  50.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.48 
 
 
596 aa  50.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  36.05 
 
 
371 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0622  putative transcriptional regulator, PucR family  26.36 
 
 
300 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  34.13 
 
 
410 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  25.19 
 
 
514 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  36.05 
 
 
371 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  40.17 
 
 
429 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>