187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5614 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  99.61 
 
 		 515 aa  991    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  99.61 
 
 		 515 aa  991    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  100 
 
 		 515 aa  995    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  67.52 
 
 		 529 aa  605  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  65.37 
 
 		 510 aa  566  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  64.36 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  60.67 
 
 		 514 aa  551  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  58.05 
 
 		 512 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  57.76 
 
 		 511 aa  510  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  54.74 
 
 		 530 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  52.94 
 
 		 522 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1496  putative transcriptional regulator, PucR family  51.17 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  36.08 
 
 		 537 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  34.39 
 
 		 547 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  32.12 
 
 		 498 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  31.35 
 
 		 611 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  32.8 
 
 		 512 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  32.13 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  29.34 
 
 		 538 aa  104  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  25.12 
 
 		 411 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  28.12 
 
 		 554 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  28.12 
 
 		 554 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  28.12 
 
 		 554 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  22.17 
 
 		 412 aa  93.2  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 532 aa  91.3  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  30.17 
 
 		 540 aa  90.9  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  26.87 
 
 		 525 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  26.35 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  56.14 
 
 		 650 aa  63.9  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  31.68 
 
 		 665 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  31.17 
 
 		 616 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  42.65 
 
 		 547 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  25.44 
 
 		 361 aa  57  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2428  putative transcriptional regulator, PucR family  32.39 
 
 		 563 aa  56.6  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  25.48 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  40 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 491 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  48.28 
 
 		 411 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  40 
 
 		 552 aa  54.7  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 419 aa  54.7  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  35.92 
 
 		 429 aa  54.7  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  52.63 
 
 		 397 aa  54.7  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  42.03 
 
 		 485 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  41.1 
 
 		 486 aa  54.3  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 517 aa  53.5  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  47.54 
 
 		 392 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  30 
 
 		 558 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.33 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  35.11 
 
 		 454 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  45.07 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  28.61 
 
 		 619 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  27.87 
 
 		 519 aa  52  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  44.26 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  49.12 
 
 		 408 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  39.44 
 
 		 535 aa  51.2  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  43.75 
 
 		 425 aa  51.6  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2412  hypothetical protein  38.96 
 
 		 386 aa  50.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  37.84 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.84 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 479 aa  51.2  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  41.77 
 
 		 681 aa  50.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 412 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  26.74 
 
 		 383 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3281  carbohydrate diacid regulator, putative  39.39 
 
 		 363 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.1 
 
 		 486 aa  50.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  37.14 
 
 		 555 aa  50.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.68 
 
 		 480 aa  50.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  45.31 
 
 		 417 aa  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  28.77 
 
 		 514 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  29.89 
 
 		 645 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  31.3 
 
 		 739 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  39.71 
 
 		 501 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  42.65 
 
 		 539 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  35.64 
 
 		 447 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  34.42 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  37.68 
 
 		 478 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 502 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  25.67 
 
 		 518 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  28.19 
 
 		 648 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  45 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  20.59 
 
 		 542 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 516 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  45.9 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1437  CdaR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 371 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  43.86 
 
 		 543 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  37.84 
 
 		 600 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 421 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 553 aa  47.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 564 aa  47.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 659 aa  47.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  40.85 
 
 		 393 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.11 
 
 		 492 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  31.4 
 
 		 561 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>