109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5270 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 522 aa  1006    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  35.39 
 
 		 547 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  32.78 
 
 		 537 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  31.93 
 
 		 511 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  32.56 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  31.16 
 
 		 611 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  31.06 
 
 		 514 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  32.71 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  31.63 
 
 		 522 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  33.68 
 
 		 498 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  32.08 
 
 		 530 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  33.92 
 
 		 515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  33.7 
 
 		 515 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  33.7 
 
 		 515 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  31.4 
 
 		 529 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1496  putative transcriptional regulator, PucR family  32.72 
 
 		 502 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  30.4 
 
 		 540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  29.5 
 
 		 538 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  29.1 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  29.1 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  29.1 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  29.48 
 
 		 514 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  29.23 
 
 		 525 aa  104  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 410 aa  94  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 532 aa  78.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  21.58 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  22.91 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 563 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  42.42 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  31.55 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  30.56 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.63 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  35.8 
 
 		 600 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  32.02 
 
 		 361 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 564 aa  55.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1109  putative transcriptional regulator, PucR family  25.83 
 
 		 515 aa  54.3  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 553 aa  53.9  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  27.51 
 
 		 442 aa  53.5  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0942  hypothetical protein  38.93 
 
 		 252 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  26.77 
 
 		 562 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  38.1 
 
 		 637 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03504  sugar diacide regulator  40 
 
 		 168 aa  51.2  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  31.17 
 
 		 616 aa  51.6  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  38.2 
 
 		 665 aa  51.2  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  33.12 
 
 		 515 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  36.9 
 
 		 644 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  37.5 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2710  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 226 aa  49.7  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  54.24 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  47.46 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 552 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  40 
 
 		 639 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  35.9 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 464 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2428  putative transcriptional regulator, PucR family  30.77 
 
 		 563 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  33.54 
 
 		 399 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 517 aa  48.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 558 aa  48.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.87 
 
 		 480 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  35.23 
 
 		 419 aa  48.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  36.11 
 
 		 602 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  27.1 
 
 		 371 aa  47  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  40.3 
 
 		 481 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  18.73 
 
 		 555 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  36.92 
 
 		 404 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  34.09 
 
 		 518 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2704  transcriptional regulator, CdaR  39.13 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  34.94 
 
 		 486 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  37.84 
 
 		 648 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  38.89 
 
 		 681 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  34.25 
 
 		 616 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  26.09 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  27.01 
 
 		 740 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  25.55 
 
 		 739 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  30.18 
 
 		 416 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  38.57 
 
 		 627 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 516 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  40 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.57 
 
 		 459 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  37.88 
 
 		 650 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  30.67 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  39.29 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 537 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  23.66 
 
 		 371 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  52.27 
 
 		 495 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03650  hypothetical protein  31.51 
 
 		 435 aa  44.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  39.19 
 
 		 645 aa  45.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  32.19 
 
 		 525 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 408 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 597 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  25.27 
 
 		 371 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  36.67 
 
 		 393 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  31.94 
 
 		 417 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  24.44 
 
 		 371 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  25 
 
 		 371 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  38.16 
 
 		 614 aa  43.9  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  29.1 
 
 		 397 aa  43.9  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>