214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1514 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 419 aa  817    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  75 
 
 		 397 aa  554  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  70.93 
 
 		 408 aa  502  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  68.98 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  62.37 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  52.67 
 
 		 392 aa  363  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  48.97 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  49.62 
 
 		 414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  51.35 
 
 		 400 aa  346  4e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  50.66 
 
 		 426 aa  345  7e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  53.46 
 
 		 425 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  50 
 
 		 403 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  48.51 
 
 		 421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  47.06 
 
 		 386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  53.49 
 
 		 404 aa  325  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  54.03 
 
 		 425 aa  317  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  48.76 
 
 		 420 aa  316  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  51.51 
 
 		 384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  52.02 
 
 		 373 aa  307  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  51.32 
 
 		 473 aa  305  8.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  42.33 
 
 		 539 aa  280  4e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  47.45 
 
 		 413 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  46.6 
 
 		 393 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  49.07 
 
 		 429 aa  276  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  42.9 
 
 		 418 aa  263  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  43.05 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  42.29 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  42.29 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  42.29 
 
 		 428 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  39.59 
 
 		 428 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  41.29 
 
 		 428 aa  246  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  45.23 
 
 		 393 aa  246  6.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  40.61 
 
 		 414 aa  244  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  46.81 
 
 		 276 aa  113  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  38.06 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  46.73 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  50.59 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  33.67 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 305 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.55 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  45.9 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  45.9 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  26.26 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 466 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 526 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  34.74 
 
 		 246 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  50 
 
 		 515 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  50 
 
 		 515 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  35.04 
 
 		 611 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2712  transcriptional regulator, CdaR  44.44 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  30 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 563 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  50 
 
 		 515 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2531  hypothetical protein  37.8 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  31.16 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  33.7 
 
 		 637 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  45.59 
 
 		 416 aa  53.5  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  34.21 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  41.58 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  51.79 
 
 		 529 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  28.45 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  45.9 
 
 		 486 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.74 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  54 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  34.21 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  46.43 
 
 		 498 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  26.36 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  39.08 
 
 		 479 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  33.08 
 
 		 562 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  34.21 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  19.74 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  34.21 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2428  putative transcriptional regulator, PucR family  36.07 
 
 		 563 aa  51.2  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  56.1 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  26.36 
 
 		 371 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  34.48 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  36.27 
 
 		 447 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  29.36 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  29.36 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  29.36 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  38.28 
 
 		 414 aa  50.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  27.59 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  29.36 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.5 
 
 		 459 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  42.37 
 
 		 377 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  36.54 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  29.29 
 
 		 371 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  42.42 
 
 		 558 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  45.59 
 
 		 644 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0792  hypothetical protein  29.63 
 
 		 364 aa  50.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.60027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 404 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>