217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2867 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 407 aa  785    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  55.98 
 
 		 466 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  46.72 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  48.65 
 
 		 434 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  43.01 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7392  putative transcriptional regulator, PucR family  43.67 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 526 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  27.11 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  24.33 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 563 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  24 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  24 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  24 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  24 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  24 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  24 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.91 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.25 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.91 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.59 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.91 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.91 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  24 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3621  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  24.84 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.91 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  40.56 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  24.92 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  43.56 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  22.66 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  30.31 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  40.78 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  38.58 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  28.18 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  32.88 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 552 aa  64.3  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  24.09 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  27.15 
 
 		 562 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  25.09 
 
 		 558 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  24.37 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  25.81 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.91 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  34.1 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  24.37 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  24.92 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  24.65 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2687  transcriptional regulator, CdaR  24.37 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  28.85 
 
 		 665 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  27.83 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  23.55 
 
 		 739 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  29.53 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  27.91 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  26.82 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  31.66 
 
 		 510 aa  59.7  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  38.81 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  30.4 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 305 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  27.82 
 
 		 525 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  41.05 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  28.57 
 
 		 525 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  31.54 
 
 		 648 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  37.96 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  28.46 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  31.54 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  23.1 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  35 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  36.89 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  29.12 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.12 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  40.59 
 
 		 428 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  40.59 
 
 		 428 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  40.59 
 
 		 428 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  39.6 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 537 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  26.44 
 
 		 600 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  39.71 
 
 		 554 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  28.77 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  39.05 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  28.77 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  34.62 
 
 		 705 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  39.05 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  28.77 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  20.36 
 
 		 555 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.77 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  32.02 
 
 		 609 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  27.99 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  40 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.77 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  36.67 
 
 		 557 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  38.61 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  29.96 
 
 		 553 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  30.08 
 
 		 619 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  38.3 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>