63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2531 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2531  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  815    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2712  transcriptional regulator, CdaR  84.42 
 
 		 401 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  40.75 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  28.03 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  40.87 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  27.57 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  25.45 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  27.06 
 
 		 399 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  47.37 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  46.67 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  28.02 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 408 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  28.57 
 
 		 406 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  40 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  40 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  40 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  28.66 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  41.38 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  33.61 
 
 		 493 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  40.91 
 
 		 393 aa  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  44.09 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  28.54 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  43.24 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  32.91 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  39.19 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  38.46 
 
 		 373 aa  47  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  39.66 
 
 		 420 aa  47  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  24.59 
 
 		 405 aa  46.6  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  39.71 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  41.54 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  41.27 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  27.25 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  39.68 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  38.24 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  47.27 
 
 		 554 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  47.27 
 
 		 554 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  47.27 
 
 		 554 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  43.33 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  27.25 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  42.67 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  35.34 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  36 
 
 		 558 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  25.12 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 434 aa  43.9  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  40 
 
 		 410 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 425 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  40 
 
 		 410 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  23.91 
 
 		 411 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  40 
 
 		 410 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  40 
 
 		 410 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  40 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  40 
 
 		 410 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13710  sugar diacid utilization regulator  33.73 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  40 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  37.78 
 
 		 517 aa  43.1  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3621  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  38.98 
 
 		 384 aa  43.1  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>