147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4807 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 386 aa  751    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  67.1 
 
 		 473 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  67.36 
 
 		 408 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  52.66 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  50.66 
 
 		 393 aa  363  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  47.61 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 403 aa  339  4e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  51.47 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  50 
 
 		 425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  47.06 
 
 		 419 aa  324  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  48.93 
 
 		 408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  48.8 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  47.67 
 
 		 421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  48.28 
 
 		 413 aa  319  6e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 420 aa  318  9e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  50.13 
 
 		 404 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  43.77 
 
 		 414 aa  311  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  44.03 
 
 		 426 aa  302  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  46.56 
 
 		 400 aa  301  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  47.73 
 
 		 394 aa  292  7e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  49.6 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  46.54 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  48.66 
 
 		 429 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  45.7 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  49.87 
 
 		 425 aa  287  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  40.78 
 
 		 539 aa  278  8e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  41.49 
 
 		 429 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  41.22 
 
 		 428 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  38.77 
 
 		 418 aa  268  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  40.99 
 
 		 414 aa  265  7e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  40.58 
 
 		 428 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  40.58 
 
 		 428 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  39.36 
 
 		 428 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  40.32 
 
 		 428 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 479 aa  186  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  40.37 
 
 		 276 aa  95.9  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  42.73 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 305 aa  67  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  32.69 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 553 aa  57  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.33 
 
 		 480 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  31.4 
 
 		 648 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 454 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  33.85 
 
 		 478 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  42.11 
 
 		 431 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  38.81 
 
 		 525 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  38.81 
 
 		 525 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  37.1 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  33.73 
 
 		 558 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 517 aa  49.7  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 494 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  25.53 
 
 		 562 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2197  transcriptional regulator, PucR family  27.05 
 
 		 540 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  24.76 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2662  putative transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.3 
 
 		 459 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  35.56 
 
 		 554 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  29.39 
 
 		 553 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  26.53 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  38.98 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  35.64 
 
 		 407 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  32.35 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  32.35 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  29.41 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  26.37 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  36.84 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 372 aa  47.8  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.84 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  35.56 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  39.71 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  42.55 
 
 		 486 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  37.88 
 
 		 393 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  31.75 
 
 		 371 aa  46.6  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3116  putative sugar diacid recognition  23.76 
 
 		 363 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3621  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  42.86 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  34.62 
 
 		 547 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  34.67 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  34.58 
 
 		 398 aa  46.2  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3281  carbohydrate diacid regulator, putative  32.14 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2909  CdaR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  34.72 
 
 		 637 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  30.3 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  37.29 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 526 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  29.25 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  29.17 
 
 		 518 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  30.77 
 
 		 614 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2516  CdaR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.882452  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  29.09 
 
 		 514 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.33 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  39.66 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  24.36 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43380  carbohydrate diacid transcriptional regulator  38.24 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>