More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3185 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 518 aa  1028    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  55.73 
 
 		 525 aa  530  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  56.11 
 
 		 525 aa  526  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 477 aa  213  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 553 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  24.73 
 
 		 555 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  27.4 
 
 		 558 aa  137  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 305 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 563 aa  124  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  29.8 
 
 		 665 aa  117  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  26.18 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  24.75 
 
 		 493 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 564 aa  110  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  27.05 
 
 		 407 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  26.08 
 
 		 538 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  29.32 
 
 		 619 aa  107  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 537 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 403 aa  99  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  27.53 
 
 		 600 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.1 
 
 		 379 aa  93.6  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  25.27 
 
 		 739 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  23.13 
 
 		 601 aa  91.7  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  28.73 
 
 		 536 aa  89.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  23.4 
 
 		 740 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 524 aa  89  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  26.37 
 
 		 705 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 552 aa  88.2  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  22.75 
 
 		 618 aa  87  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  25.87 
 
 		 602 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  27.76 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  36.03 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  30.24 
 
 		 648 aa  84.3  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  28.36 
 
 		 485 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  35.56 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  20.85 
 
 		 537 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  32.86 
 
 		 520 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  23.84 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  39.84 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  25.09 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  35.14 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  34.4 
 
 		 411 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  20.66 
 
 		 542 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.82 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.82 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.82 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.97 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.82 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  27.92 
 
 		 554 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.82 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  29.45 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  33.06 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  38.32 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  31.03 
 
 		 562 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  32.77 
 
 		 518 aa  77.8  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  27.69 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 597 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.73 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  29.45 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.45 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.45 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  29.45 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.45 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  30.56 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  29.45 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  27.49 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.45 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  23.69 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  32.96 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  27.59 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0789  putative transcriptional regulator, PucR family  22.51 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.691092  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 659 aa  75.1  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  35.4 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  27.82 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  23.32 
 
 		 553 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  27.55 
 
 		 543 aa  73.6  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0150  transcriptional regulator, CdaR  29.35 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.35 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  24.11 
 
 		 647 aa  73.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  30 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  23.38 
 
 		 353 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  26.21 
 
 		 537 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1604  putative GAF sensor protein  34.13 
 
 		 631 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1774  putative sugar diacid utilization regulator  26.73 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.31 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.45 
 
 		 385 aa  72.8  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  26.44 
 
 		 501 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  30.94 
 
 		 383 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  24.71 
 
 		 616 aa  72.4  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  26.32 
 
 		 627 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  31.52 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  34.59 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  34.59 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  34.44 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  32.17 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.59 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  29.82 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>