295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0545 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 547 aa  1105    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 403 aa  187  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  36.46 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  33.82 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  28.17 
 
 		 413 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  29.25 
 
 		 406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  32.06 
 
 		 409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  31.02 
 
 		 408 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  24.25 
 
 		 555 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 564 aa  103  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 305 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 553 aa  97.4  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  25.39 
 
 		 558 aa  95.9  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  29.07 
 
 		 404 aa  95.1  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  29.61 
 
 		 525 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  25.14 
 
 		 740 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  28.39 
 
 		 518 aa  90.1  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  25.45 
 
 		 520 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 563 aa  89.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 537 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2516  CdaR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.882452  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  20.27 
 
 		 562 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 659 aa  86.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  28.95 
 
 		 525 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  27.56 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.33 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2584  CdaR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2682  CdaR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250773 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  28.87 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2528  transcriptional regulator, CdaR  27.24 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  30.18 
 
 		 520 aa  83.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  26.98 
 
 		 385 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1774  putative sugar diacid utilization regulator  27.86 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  27.46 
 
 		 514 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 552 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  26.64 
 
 		 665 aa  77.4  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  31.54 
 
 		 505 aa  77  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  23.9 
 
 		 538 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1573  transcriptional regulator, CdaR  26.28 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  25.85 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  22.84 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  32.37 
 
 		 705 aa  73.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  33.6 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2770  transcriptional regulator, CdaR  26.67 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0333515  hitchhiker  0.000000603935 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  25.86 
 
 		 648 aa  73.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  33.81 
 
 		 515 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 552 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1607  transcriptional regulator, CdaR  26.22 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  25.24 
 
 		 383 aa  72  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  23.34 
 
 		 616 aa  72  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  31.82 
 
 		 511 aa  70.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  27.39 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  30.28 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1473  transcriptional regulator, CdaR  25.89 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  32 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  22.75 
 
 		 739 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 405 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  23.55 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  42.5 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  27.44 
 
 		 618 aa  69.3  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  25.48 
 
 		 619 aa  68.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  22.83 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  22.83 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2687  transcriptional regulator, CdaR  22.83 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  27.38 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  22.83 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  24.36 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.87 
 
 		 601 aa  67.4  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  25.41 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  25.08 
 
 		 650 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  26.51 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  28.68 
 
 		 562 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  25.41 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  25.41 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.95 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  25.41 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  26.62 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  25.44 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.95 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  25.41 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  25.41 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  29.93 
 
 		 547 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.95 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  25.55 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.95 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.55 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.95 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  25.55 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  25.71 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  25.55 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.55 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.55 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  24.68 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.57 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.55 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  39.78 
 
 		 514 aa  63.9  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>