171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3449 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 398 aa  757    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  56.14 
 
 		 434 aa  338  7e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  42.3 
 
 		 466 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  45.95 
 
 		 405 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  42.05 
 
 		 407 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7392  putative transcriptional regulator, PucR family  42.05 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 526 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 563 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  26.74 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  33.9 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  30.77 
 
 		 525 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  45.45 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.93 
 
 		 555 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  23.15 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  37.59 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  46.73 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  31.13 
 
 		 665 aa  70.1  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  46.67 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  42.06 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  24.24 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  25.51 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  40.95 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  43.88 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  38.89 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  28.32 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  44.79 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  37.86 
 
 		 429 aa  66.2  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  43.81 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  31.22 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  40.15 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  40.15 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  40.15 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  24.91 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  41.12 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  36.92 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  41.44 
 
 		 539 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  26.13 
 
 		 547 aa  63.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  40.95 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  42.99 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  26.15 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  37.06 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  39.64 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  38.97 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  43.3 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.34 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  25.6 
 
 		 558 aa  59.7  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  26.54 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  40 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 553 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  38.06 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  38.24 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  37.65 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.56 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.65 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 537 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  43.3 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  30.63 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  25.45 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  20.7 
 
 		 381 aa  57  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  28.36 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  41.46 
 
 		 493 aa  56.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  29.37 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  36.76 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  33.96 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  36.64 
 
 		 637 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  33.81 
 
 		 478 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  26.76 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  27.11 
 
 		 429 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  27.03 
 
 		 411 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  20.37 
 
 		 562 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  28.73 
 
 		 648 aa  53.9  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  37.62 
 
 		 393 aa  53.9  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  34.16 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  27.73 
 
 		 353 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 477 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  35.48 
 
 		 558 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  24.82 
 
 		 542 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.17 
 
 		 379 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  28.83 
 
 		 705 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  28.99 
 
 		 645 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  31.96 
 
 		 520 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 552 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  28.21 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  29.17 
 
 		 505 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  43.82 
 
 		 644 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  32.16 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  35.71 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  23.7 
 
 		 380 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  26.89 
 
 		 353 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>