More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8514 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 637 aa  1218    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  61.11 
 
 		 645 aa  665    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  63.64 
 
 		 644 aa  632  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  62.48 
 
 		 627 aa  611  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  56.98 
 
 		 665 aa  611  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  63.07 
 
 		 639 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  56.28 
 
 		 648 aa  570  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  58.28 
 
 		 647 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  53.73 
 
 		 619 aa  502  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  50.47 
 
 		 614 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 659 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 563 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  28.52 
 
 		 553 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  29.37 
 
 		 705 aa  118  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  29.97 
 
 		 562 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 597 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  27.52 
 
 		 741 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  28.89 
 
 		 602 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  102  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 403 aa  99.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  25.25 
 
 		 600 aa  97.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  21.57 
 
 		 739 aa  97.1  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 553 aa  89.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.71 
 
 		 356 aa  89.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2842  diguanylate cyclase  33.5 
 
 		 785 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.06 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  35.63 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  25.52 
 
 		 558 aa  83.2  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 1017 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2470  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.91 
 
 		 756 aa  81.6  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.578353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  27.11 
 
 		 616 aa  81.3  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  27.32 
 
 		 848 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  29.76 
 
 		 525 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  25.59 
 
 		 650 aa  78.2  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  32.27 
 
 		 525 aa  77.4  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 2783 aa  77.4  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1949  diguanylate cyclase  32.5 
 
 		 733 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2414  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  35.76 
 
 		 756 aa  75.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  29.55 
 
 		 518 aa  75.5  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 545 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 		 571 aa  74.3  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  39.57 
 
 		 616 aa  73.9  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 1014 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 552 aa  72.8  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3833  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.5 
 
 		 732 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4627  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 662 aa  71.2  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622134  hitchhiker  0.00510111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 819 aa  71.6  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 548 aa  71.2  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 647 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03709  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  29.34 
 
 		 772 aa  70.1  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 726 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  39.6 
 
 		 557 aa  70.1  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  31.25 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  28.07 
 
 		 554 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3631  signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 666 aa  69.3  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 564 aa  68.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  27.87 
 
 		 520 aa  68.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  28.33 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.79 
 
 		 601 aa  67.4  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 544 aa  67.4  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.21 
 
 		 995 aa  67  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  32 
 
 		 342 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  28.87 
 
 		 425 aa  66.6  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  27.93 
 
 		 399 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  24.72 
 
 		 371 aa  66.6  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  21.26 
 
 		 555 aa  67  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  32.86 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  26.42 
 
 		 585 aa  66.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 545 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  20.16 
 
 		 740 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 		 574 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4216  diguanylate cyclase  26.98 
 
 		 717 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  26.48 
 
 		 538 aa  66.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0495  CdaR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 645 aa  65.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  27.24 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  25.69 
 
 		 719 aa  65.1  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  42.5 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0442  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.62 
 
 		 1785 aa  65.1  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 715 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  32.04 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  27.03 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 602 aa  63.9  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.525886  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  26.79 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 2161 aa  63.9  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  26.79 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  26.79 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  31.4 
 
 		 514 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  35.1 
 
 		 501 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 494 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.18 
 
 		 1101 aa  63.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  26.59 
 
 		 534 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  31.92 
 
 		 434 aa  63.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  26.79 
 
 		 410 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  26.79 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  27.29 
 
 		 505 aa  63.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  26.79 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  43.04 
 
 		 543 aa  62  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 		 715 aa  62.4  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.99155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>