225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0879 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  744    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  57.89 
 
 		 393 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  58.13 
 
 		 425 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  58.84 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  57.14 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  55.56 
 
 		 420 aa  368  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  55.67 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  52.79 
 
 		 414 aa  362  7.0000000000000005e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 403 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  52.79 
 
 		 426 aa  355  8.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  51.47 
 
 		 386 aa  352  5.9999999999999994e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  53.46 
 
 		 408 aa  341  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  56.06 
 
 		 373 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  49.73 
 
 		 397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  54.62 
 
 		 473 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 408 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  51.37 
 
 		 419 aa  331  1e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  46.88 
 
 		 400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  52.88 
 
 		 425 aa  316  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  50.66 
 
 		 394 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  47.19 
 
 		 539 aa  306  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  50.67 
 
 		 397 aa  306  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  49.87 
 
 		 413 aa  303  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  49.47 
 
 		 393 aa  290  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  44.97 
 
 		 418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  46.01 
 
 		 429 aa  283  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  49.21 
 
 		 429 aa  275  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  45.91 
 
 		 428 aa  269  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  44.95 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  44.95 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  44.95 
 
 		 428 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  44.33 
 
 		 428 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  45.8 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  43.26 
 
 		 414 aa  257  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  51.83 
 
 		 479 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  44.59 
 
 		 276 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  46.15 
 
 		 453 aa  90.9  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  31.71 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  40.78 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  36.17 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.89 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  28.25 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  38.16 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  32.3 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4484  putative transcriptional regulator, PucR family  40.91 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.402234  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  45.45 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 552 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  38.61 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  38.57 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 494 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  43.55 
 
 		 442 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 553 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  38.55 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 466 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 517 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 526 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  45.61 
 
 		 558 aa  53.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  36.5 
 
 		 383 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  27.79 
 
 		 418 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  49.12 
 
 		 514 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2110  transcriptional regulator, CdaR  25.83 
 
 		 386 aa  52.8  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3281  carbohydrate diacid regulator, putative  41.07 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3116  putative sugar diacid recognition  36.11 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  30.13 
 
 		 648 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  30.21 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  49.12 
 
 		 501 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  44.64 
 
 		 459 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  43.1 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  47.62 
 
 		 395 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 518 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  30.84 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  45.28 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  30.92 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  33.95 
 
 		 681 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7392  putative transcriptional regulator, PucR family  35.92 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  16.94 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  35.48 
 
 		 353 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  47.92 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  29.3 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  42.11 
 
 		 554 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  35.48 
 
 		 353 aa  50.4  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 514 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  42.11 
 
 		 554 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  42.11 
 
 		 554 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  42.11 
 
 		 493 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  29.91 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  42.42 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 372 aa  50.1  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  47.37 
 
 		 405 aa  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  29.72 
 
 		 492 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0792  hypothetical protein  27.12 
 
 		 364 aa  49.7  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.60027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  34.94 
 
 		 558 aa  49.7  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>