More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1241 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 552 aa  1057    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  64.73 
 
 		 501 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  38.98 
 
 		 505 aa  299  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  40.45 
 
 		 514 aa  293  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  40.41 
 
 		 520 aa  276  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  38.73 
 
 		 543 aa  263  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  38.46 
 
 		 515 aa  263  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  30.48 
 
 		 478 aa  120  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  52.08 
 
 		 561 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.71 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  40.61 
 
 		 486 aa  104  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  26.82 
 
 		 558 aa  100  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 517 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  41.18 
 
 		 517 aa  83.2  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.26 
 
 		 445 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  40.59 
 
 		 558 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 516 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  28.63 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  35 
 
 		 553 aa  79.7  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 563 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  38.55 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  34.98 
 
 		 535 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  47.3 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  28.54 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  46.25 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  28.81 
 
 		 504 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.05 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  29.32 
 
 		 520 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  34.97 
 
 		 705 aa  75.1  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  46.75 
 
 		 485 aa  75.5  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  36.88 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  30.39 
 
 		 619 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  36.17 
 
 		 637 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  44.86 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 564 aa  72.4  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  42.34 
 
 		 644 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  34.51 
 
 		 515 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  36.19 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  52 
 
 		 681 aa  70.5  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  31 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  41.59 
 
 		 495 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  38.55 
 
 		 512 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  35.46 
 
 		 645 aa  69.7  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  37.78 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  30.34 
 
 		 537 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  37.18 
 
 		 547 aa  67.8  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  39.6 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  36.89 
 
 		 412 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.89 
 
 		 412 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  39.74 
 
 		 525 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  37.37 
 
 		 547 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 514 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  48.53 
 
 		 611 aa  66.6  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1604  putative GAF sensor protein  31.38 
 
 		 631 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  35.25 
 
 		 562 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 659 aa  66.6  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 412 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  38.46 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  29.05 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  28.74 
 
 		 562 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  42.86 
 
 		 648 aa  64.7  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  25.32 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0552  transcriptional regulator, CdaR  26.99 
 
 		 513 aa  63.9  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  26.77 
 
 		 536 aa  64.3  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  45.71 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  45.45 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  37.18 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  34.31 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  43.44 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  41.67 
 
 		 639 aa  63.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  31.9 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  41.76 
 
 		 553 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  30.32 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  23.52 
 
 		 520 aa  62  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  34.86 
 
 		 647 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  36.71 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  20.59 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  21.51 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  26.62 
 
 		 739 aa  60.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  38.05 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  27.29 
 
 		 555 aa  60.5  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 408 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  32.18 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  32.18 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  36.36 
 
 		 616 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  50.88 
 
 		 498 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  40.26 
 
 		 627 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  32.18 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.59 
 
 		 501 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  33.95 
 
 		 460 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>