236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4102 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1068    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1068    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  71.2 
 
 		 525 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1068    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  63.99 
 
 		 538 aa  627  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  45.4 
 
 		 540 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 512 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  37.77 
 
 		 611 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  37.83 
 
 		 498 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 532 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  29.59 
 
 		 537 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  29.38 
 
 		 511 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  30.69 
 
 		 530 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  31.22 
 
 		 529 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  27.47 
 
 		 512 aa  100  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  26.94 
 
 		 514 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  28.12 
 
 		 515 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1496  putative transcriptional regulator, PucR family  30.86 
 
 		 502 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  28.02 
 
 		 515 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  28.02 
 
 		 515 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  29.14 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  28.41 
 
 		 514 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  30.37 
 
 		 442 aa  87  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  28.32 
 
 		 522 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  27.47 
 
 		 510 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  19.44 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  21.93 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  32.06 
 
 		 522 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  41.56 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  47.89 
 
 		 558 aa  69.7  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  46.75 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  28.75 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  52.54 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  38.33 
 
 		 514 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  51.61 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  40.71 
 
 		 562 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  49.18 
 
 		 365 aa  62  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  37.89 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  39.66 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  41.67 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  39.42 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  50 
 
 		 514 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  39.42 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  39.42 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  42.5 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  36.78 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 552 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  24.23 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  50.85 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  45.76 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  35.16 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  47.62 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  48.33 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  46.03 
 
 		 409 aa  57  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  36.36 
 
 		 402 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  31.75 
 
 		 512 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  49.12 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  40.7 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  39.33 
 
 		 399 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  25 
 
 		 413 aa  56.2  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  46.43 
 
 		 505 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  31.19 
 
 		 493 aa  55.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  40.3 
 
 		 447 aa  55.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  41.33 
 
 		 425 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  39.06 
 
 		 407 aa  54.7  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  45.61 
 
 		 415 aa  54.7  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  36.36 
 
 		 525 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 561 aa  54.7  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  30.58 
 
 		 383 aa  54.3  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3802  putative transcriptional regulator, PucR family  25.58 
 
 		 406 aa  53.5  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  45.31 
 
 		 418 aa  53.5  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.95 
 
 		 601 aa  53.5  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  38.24 
 
 		 418 aa  53.5  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  49.18 
 
 		 485 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  47.69 
 
 		 399 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 384 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  35.9 
 
 		 505 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 372 aa  52.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  34.74 
 
 		 515 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22850  hypothetical protein  49.25 
 
 		 495 aa  52.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.450672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  38.03 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4050  putative carbohydrate diacid regulator  28.42 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  38.71 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4118  putative transcriptional regulator, PucR family  41.54 
 
 		 498 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  30.77 
 
 		 486 aa  52  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  37.7 
 
 		 385 aa  52  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0113  transcriptional regulator, CdaR  28.42 
 
 		 375 aa  52  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  45.61 
 
 		 543 aa  52  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  34.67 
 
 		 525 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  35.38 
 
 		 404 aa  51.6  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  46 
 
 		 413 aa  51.2  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 379 aa  51.2  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 515 aa  51.2  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.79 
 
 		 445 aa  51.2  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  45.76 
 
 		 397 aa  51.2  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 381 aa  50.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 502 aa  50.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  44.83 
 
 		 609 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>