56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3802 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4011  transcriptional regulator  87.19 
 
 		 406 aa  650    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3802  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 406 aa  819    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  27.42 
 
 		 442 aa  109  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  27.18 
 
 		 403 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  45.63 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3098  transcriptional regulator, CdaR  26.17 
 
 		 361 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102834  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  25.69 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  37.76 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  22.09 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  40.4 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  20.6 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  20.68 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  25.56 
 
 		 554 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  25.56 
 
 		 554 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  25.56 
 
 		 554 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  33.96 
 
 		 525 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  41.67 
 
 		 543 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  33.65 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  33.02 
 
 		 525 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4484  putative transcriptional regulator, PucR family  36.73 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.402234  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  33 
 
 		 530 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 514 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  40.28 
 
 		 478 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  34.95 
 
 		 522 aa  49.7  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.05 
 
 		 480 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  19.35 
 
 		 537 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  31.51 
 
 		 561 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 659 aa  47.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  29.29 
 
 		 515 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  29.29 
 
 		 515 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  29.29 
 
 		 515 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  37.31 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  27.01 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  24.63 
 
 		 558 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  28 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  40 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  32.93 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  25.83 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  37.88 
 
 		 400 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2909  CdaR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 549 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 564 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  28.46 
 
 		 637 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  30.3 
 
 		 529 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  36.51 
 
 		 740 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2110  transcriptional regulator, CdaR  41.67 
 
 		 386 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  39.19 
 
 		 582 aa  43.5  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.67 
 
 		 412 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  34.67 
 
 		 412 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 312 aa  43.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  34.85 
 
 		 555 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>