136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2205 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 505 aa  958    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4118  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 498 aa  280  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  36.96 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 514 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  31.66 
 
 		 524 aa  85.1  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  34.44 
 
 		 518 aa  73.6  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 563 aa  73.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  25.14 
 
 		 562 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  29.56 
 
 		 558 aa  63.5  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  52.38 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  28.83 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.21 
 
 		 555 aa  60.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  29.32 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 410 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  29.07 
 
 		 665 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22850  hypothetical protein  37.32 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.450672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  33.12 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  33.12 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  33.12 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.69 
 
 		 601 aa  57  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  38.89 
 
 		 637 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  46.43 
 
 		 525 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  31.37 
 
 		 739 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  40.54 
 
 		 400 aa  54.3  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  28.86 
 
 		 618 aa  53.9  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  48.33 
 
 		 498 aa  54.3  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  48.33 
 
 		 525 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  29.05 
 
 		 398 aa  53.9  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 552 aa  53.5  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  35.88 
 
 		 561 aa  53.5  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1604  putative GAF sensor protein  29.31 
 
 		 631 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  28.48 
 
 		 436 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  40.79 
 
 		 493 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  29.01 
 
 		 389 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  43.84 
 
 		 525 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  27.36 
 
 		 644 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  28.83 
 
 		 537 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 312 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 405 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  36.9 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  32.71 
 
 		 543 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.66 
 
 		 459 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 405 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 564 aa  50.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  33.04 
 
 		 442 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  28.43 
 
 		 639 aa  50.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  26.76 
 
 		 562 aa  50.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  45.9 
 
 		 512 aa  50.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  33.77 
 
 		 420 aa  50.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 537 aa  50.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 386 aa  50.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  28.22 
 
 		 520 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  24.26 
 
 		 399 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.28 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  43.84 
 
 		 428 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  39.68 
 
 		 529 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  42.11 
 
 		 547 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  33.81 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 553 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  26.72 
 
 		 399 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  21.33 
 
 		 361 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  34.51 
 
 		 400 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  46.03 
 
 		 528 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  27.54 
 
 		 558 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  32.16 
 
 		 515 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  24.82 
 
 		 619 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  27.27 
 
 		 614 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  29.8 
 
 		 540 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  41.67 
 
 		 485 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  49.09 
 
 		 535 aa  48.5  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  42.86 
 
 		 486 aa  48.5  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  19.44 
 
 		 379 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  21.23 
 
 		 406 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  20.71 
 
 		 411 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  32.87 
 
 		 434 aa  48.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  29.59 
 
 		 740 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  45.45 
 
 		 514 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  46.81 
 
 		 512 aa  47.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 381 aa  47.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 515 aa  47.4  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  22.22 
 
 		 412 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  42.37 
 
 		 479 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  30.32 
 
 		 501 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  37.68 
 
 		 415 aa  47  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  38.67 
 
 		 520 aa  47  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 502 aa  47  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.05 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  29.66 
 
 		 538 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 462 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  21.19 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  36.99 
 
 		 392 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  40.54 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  25.19 
 
 		 547 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>