203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0388 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  100 
 
 		 379 aa  770    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13710  sugar diacid utilization regulator  24.8 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  38.1 
 
 		 518 aa  93.2  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 558 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 564 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  35.86 
 
 		 525 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  28.57 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  34.04 
 
 		 525 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  24.54 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  26.43 
 
 		 609 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  33.56 
 
 		 547 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 553 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.79 
 
 		 601 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  29.86 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  24.8 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  30.22 
 
 		 537 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  31.97 
 
 		 562 aa  73.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  29.49 
 
 		 542 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 537 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  31.06 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  34.71 
 
 		 555 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  40 
 
 		 563 aa  69.3  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  32.1 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  29.41 
 
 		 739 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  30.71 
 
 		 705 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  26.17 
 
 		 618 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  37.62 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  28.57 
 
 		 740 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  22.73 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2704  transcriptional regulator, CdaR  21.71 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  27.04 
 
 		 538 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  37.93 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  30 
 
 		 536 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2197  transcriptional regulator, PucR family  27.92 
 
 		 540 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  28.93 
 
 		 520 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 552 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  29.27 
 
 		 558 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  31.93 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 659 aa  60.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  28.67 
 
 		 518 aa  60.1  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  33.1 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  28.71 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  24.84 
 
 		 562 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  25.31 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03650  hypothetical protein  29.27 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  22.49 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  22.49 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  22.49 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  29.77 
 
 		 566 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  25.78 
 
 		 520 aa  56.6  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  35.06 
 
 		 650 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  28.22 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  31.82 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  22.49 
 
 		 410 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  22.49 
 
 		 410 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  22.49 
 
 		 410 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  31.36 
 
 		 514 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.14 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  27.12 
 
 		 501 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  24.24 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  25.56 
 
 		 536 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 552 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  20.92 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.16 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  39.34 
 
 		 478 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  29.75 
 
 		 518 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2528  transcriptional regulator, CdaR  32.87 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 454 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.33 
 
 		 459 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  25.17 
 
 		 398 aa  53.1  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  21.54 
 
 		 486 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  29.85 
 
 		 575 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  24.46 
 
 		 585 aa  53.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2710  putative transcriptional regulator, PucR family  26.55 
 
 		 226 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  44 
 
 		 547 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  29.25 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  26.36 
 
 		 741 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2909  CdaR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  28.28 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  25.27 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  30.38 
 
 		 557 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  31.67 
 
 		 543 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2428  putative transcriptional regulator, PucR family  28.16 
 
 		 563 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  30.12 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  34.43 
 
 		 512 aa  49.7  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  28.69 
 
 		 413 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  22.79 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1844  putative transcriptional regulator, PucR family  29.13 
 
 		 150 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000616925  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  25.34 
 
 		 493 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  25.29 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>