More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_1380 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  100 
 
 		 403 aa  819    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  30.85 
 
 		 407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  29.7 
 
 		 413 aa  173  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  36.48 
 
 		 547 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  29.37 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  29.77 
 
 		 404 aa  159  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  27.76 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2339  transcriptional regulator, CdaR  26.54 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.46045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  26.33 
 
 		 555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 553 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 564 aa  123  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  26.14 
 
 		 558 aa  122  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  27.83 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  27.12 
 
 		 562 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 537 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  26.42 
 
 		 520 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  26.22 
 
 		 740 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  28.43 
 
 		 665 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 305 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  28.1 
 
 		 525 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  29.64 
 
 		 525 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  27.5 
 
 		 627 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  23.95 
 
 		 538 aa  93.2  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  28.83 
 
 		 619 aa  92.8  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  26.19 
 
 		 585 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  27.88 
 
 		 518 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  25.18 
 
 		 618 aa  92  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  26.62 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  27.33 
 
 		 438 aa  90.9  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  29.53 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  29.53 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.45 
 
 		 410 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.53 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  29.45 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.45 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 659 aa  89.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.5 
 
 		 601 aa  87.4  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  26.92 
 
 		 645 aa  87  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  31.23 
 
 		 637 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 563 aa  86.7  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  23.55 
 
 		 739 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  28.47 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  28.47 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  26 
 
 		 616 aa  84  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  30.32 
 
 		 515 aa  82.8  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  27.78 
 
 		 644 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 705 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  27.82 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 597 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  36.11 
 
 		 609 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  27.37 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  25.84 
 
 		 614 aa  79.7  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  25.13 
 
 		 648 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  24.91 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  35.66 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  32 
 
 		 542 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  27.3 
 
 		 562 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  27.16 
 
 		 647 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  26.33 
 
 		 501 aa  76.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.97 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  23.21 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  28.57 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  42.31 
 
 		 505 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  30.07 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  29.01 
 
 		 537 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  38.02 
 
 		 561 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  26.3 
 
 		 547 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  27.17 
 
 		 639 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1774  putative sugar diacid utilization regulator  24.54 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  27.48 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  24.66 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  23.31 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.04 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  24.44 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  24.05 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  22.79 
 
 		 602 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  25.99 
 
 		 650 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  25.61 
 
 		 616 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  25.71 
 
 		 553 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  26.63 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2682  CdaR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250773 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2516  CdaR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.882452  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2584  CdaR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  25.82 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  29.71 
 
 		 518 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.56 
 
 		 509 aa  67  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  24.57 
 
 		 558 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  34.11 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  28.89 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  25.99 
 
 		 600 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  23.78 
 
 		 543 aa  66.2  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  25.34 
 
 		 512 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>