219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1604 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1604  putative GAF sensor protein  100 
 
 
631 aa  1265    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  32.89 
 
 
518 aa  81.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3631  signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
666 aa  80.9  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281267  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
552 aa  75.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  27.51 
 
 
665 aa  74.7  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4627  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 
662 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622134  hitchhiker  0.00510111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
564 aa  72  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1116  hypothetical protein  29.41 
 
 
245 aa  67  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0602606  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
647 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  24.06 
 
 
645 aa  65.1  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2576  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  31.1 
 
 
755 aa  64.7  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  29.39 
 
 
505 aa  64.3  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  25.68 
 
 
555 aa  63.9  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2935  putative GAF sensor protein  25.73 
 
 
242 aa  63.9  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000271944  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04410  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  27.12 
 
 
759 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210581  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
399 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0430  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  27.12 
 
 
759 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2680  putative GAF sensor protein  27.33 
 
 
245 aa  63.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.181755  normal  0.469967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 
636 aa  62  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  25.9 
 
 
553 aa  62  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
403 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0884  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  34.92 
 
 
755 aa  61.6  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1185  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  34.38 
 
 
744 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000619187  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3128  PTSINtr with GAF domain, PtsP  34.38 
 
 
744 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000159427  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03709  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  32.46 
 
 
772 aa  61.2  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1262  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  34.38 
 
 
744 aa  61.2  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00847446  normal  0.0851964 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1229  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  34.38 
 
 
744 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00679774  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  35.48 
 
 
525 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1332  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  34.38 
 
 
744 aa  61.2  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  34.68 
 
 
525 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 
401 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  31.25 
 
 
616 aa  60.8  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 
401 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 
401 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1143  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  33.59 
 
 
744 aa  60.8  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0190957  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1734  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  29.46 
 
 
759 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  33.33 
 
 
558 aa  60.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0815  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  28.14 
 
 
768 aa  60.1  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.552071  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0439  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  29.46 
 
 
766 aa  60.1  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.293101  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5284  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  30 
 
 
759 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4842  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  30 
 
 
759 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2864  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  33.59 
 
 
744 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000439505  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2946  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  33.59 
 
 
744 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00960304  normal  0.595887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3042  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  33.59 
 
 
744 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00619839  normal  0.738534 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.57 
 
 
356 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4217  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  25.99 
 
 
759 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  31.43 
 
 
616 aa  58.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  26.62 
 
 
518 aa  58.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  31.82 
 
 
514 aa  58.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.13 
 
 
2153 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  31.82 
 
 
518 aa  58.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  35.21 
 
 
561 aa  58.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5377  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  30.43 
 
 
759 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.839628  normal  0.0308961 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2313  PTS system, enzyme I, transcriptional regulator PtsP  25.45 
 
 
782 aa  57.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3845  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  28.06 
 
 
762 aa  57.8  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48230  Phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  30.43 
 
 
759 aa  57.8  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.492707  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0348  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  29.17 
 
 
756 aa  57.4  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.130552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  34.67 
 
 
619 aa  57  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  28.15 
 
 
647 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0864  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  29.92 
 
 
744 aa  57  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00610428  normal  0.087178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2414  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  33.9 
 
 
756 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2781  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  34.21 
 
 
774 aa  56.2  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0331123  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  25.93 
 
 
399 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  33.96 
 
 
600 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  24.23 
 
 
520 aa  55.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5145  PTSINtr with GAF domain, PtsP  28.99 
 
 
759 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.498029  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5198  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  28.99 
 
 
759 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0320  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  28.99 
 
 
759 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.874945  normal  0.406154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  30.43 
 
 
501 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  30.17 
 
 
609 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1133  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  31.86 
 
 
744 aa  55.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000186405  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5052  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  28.99 
 
 
759 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  25.75 
 
 
650 aa  55.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  30.77 
 
 
553 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  29.69 
 
 
410 aa  54.7  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  29.69 
 
 
410 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  20.57 
 
 
399 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0428  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  34.45 
 
 
754 aa  54.7  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  32.43 
 
 
637 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  29.69 
 
 
410 aa  54.7  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.69 
 
 
410 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.69 
 
 
410 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.69 
 
 
410 aa  54.7  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0181  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
388 aa  54.3  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.610235  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 
611 aa  54.3  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  25 
 
 
493 aa  54.3  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  30.38 
 
 
505 aa  54.3  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  29.66 
 
 
602 aa  53.9  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  23.23 
 
 
574 aa  53.9  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  24.32 
 
 
403 aa  53.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  29.84 
 
 
410 aa  53.5  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  26.13 
 
 
618 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
597 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3747  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  33.33 
 
 
762 aa  53.5  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0123181  hitchhiker  0.00359985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2404  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  23.39 
 
 
784 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0011664  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
305 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  28.3 
 
 
311 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
537 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
563 aa  52  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1010  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  31.36 
 
 
755 aa  52  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>