133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4118 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4118  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 498 aa  968    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  40.2 
 
 		 505 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  37.4 
 
 		 460 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  31.83 
 
 		 524 aa  91.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 468 aa  87.4  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 514 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 558 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  30.11 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 563 aa  60.1  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  32.74 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  22.81 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  27.5 
 
 		 739 aa  57.4  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.7 
 
 		 555 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  29.29 
 
 		 398 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  31.4 
 
 		 365 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.97 
 
 		 601 aa  54.7  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  28.76 
 
 		 408 aa  53.5  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  42.05 
 
 		 535 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 564 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  35.94 
 
 		 515 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  28.28 
 
 		 514 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  27.07 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  28.98 
 
 		 648 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  41.54 
 
 		 554 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  41.54 
 
 		 554 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  33.67 
 
 		 562 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  41.54 
 
 		 554 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  26.37 
 
 		 525 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  43.86 
 
 		 538 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  30.92 
 
 		 525 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  35.14 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22850  hypothetical protein  31.65 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.450672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 402 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  32.59 
 
 		 383 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  27.59 
 
 		 616 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 552 aa  51.2  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  40.79 
 
 		 637 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43380  carbohydrate diacid transcriptional regulator  33.33 
 
 		 367 aa  51.6  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251481  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  34.62 
 
 		 493 aa  51.6  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  35.87 
 
 		 557 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 403 aa  50.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  32.19 
 
 		 501 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.64 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  42.11 
 
 		 525 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  38.75 
 
 		 665 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  32.85 
 
 		 399 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27560  regulatory helix-turn-helix protein, lysR family  45.9 
 
 		 413 aa  50.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.144166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0203  carbohydrate diacid regulator  38.36 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 659 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  30.16 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  29.41 
 
 		 436 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  19.87 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  21.9 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  36.99 
 
 		 495 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.5 
 
 		 480 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  34.94 
 
 		 389 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1109  putative transcriptional regulator, PucR family  21.92 
 
 		 515 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  24.91 
 
 		 425 aa  48.5  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  41.25 
 
 		 481 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  32.06 
 
 		 644 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1640  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 488 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0265  putative carbohydrate diacid regulator  36.99 
 
 		 483 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18471  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  35.71 
 
 		 486 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  42.62 
 
 		 619 aa  47.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0175  carbohydrate diacid regulator  36.99 
 
 		 488 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  30.3 
 
 		 512 aa  47.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  37.7 
 
 		 614 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.95 
 
 		 385 aa  47  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.95 
 
 		 385 aa  47  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.95 
 
 		 385 aa  47  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 390 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  37.14 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  30.41 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.14 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.95 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.95 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  25.36 
 
 		 547 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  40.35 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  31.36 
 
 		 609 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  32.35 
 
 		 547 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  26.45 
 
 		 618 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  35 
 
 		 540 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  42.59 
 
 		 531 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  23.77 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  23.77 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.14 
 
 		 492 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.12 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  32.86 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  27.55 
 
 		 740 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  29.46 
 
 		 543 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.21 
 
 		 385 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  41.07 
 
 		 561 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  39.44 
 
 		 539 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  29.78 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.12 
 
 		 385 aa  45.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>