More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2139 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 514 aa  997    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  44.27 
 
 		 501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  38.31 
 
 		 520 aa  274  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 552 aa  270  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  36.94 
 
 		 505 aa  264  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  37.81 
 
 		 515 aa  256  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  35.27 
 
 		 543 aa  217  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  31.73 
 
 		 486 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  28.24 
 
 		 558 aa  117  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  51.08 
 
 		 561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 553 aa  103  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  27.09 
 
 		 478 aa  95.1  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 558 aa  93.6  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  28.18 
 
 		 502 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.44 
 
 		 480 aa  86.7  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.12 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.63 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  25.99 
 
 		 512 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.92 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  27.8 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  34.36 
 
 		 616 aa  76.6  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  46.34 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  35.62 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  20.74 
 
 		 562 aa  73.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 563 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.37 
 
 		 486 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.9 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  24.44 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  34.36 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  45.45 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  34.88 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  27.2 
 
 		 407 aa  70.1  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.88 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  26.34 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  32.87 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  35.63 
 
 		 517 aa  67.4  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  28.99 
 
 		 562 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  37.21 
 
 		 504 aa  67  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  39.81 
 
 		 525 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  35.77 
 
 		 518 aa  67  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  24.94 
 
 		 408 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  19.89 
 
 		 555 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  25.35 
 
 		 547 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  44.3 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  36.99 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  28.92 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  42.35 
 
 		 519 aa  63.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  36.31 
 
 		 619 aa  63.9  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 659 aa  63.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  35.21 
 
 		 645 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  35.25 
 
 		 554 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.69 
 
 		 445 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  35.25 
 
 		 554 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  35.25 
 
 		 554 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  42.65 
 
 		 511 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  33.51 
 
 		 637 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  42.25 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  35.71 
 
 		 609 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  34.25 
 
 		 665 aa  61.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  32.86 
 
 		 705 aa  61.2  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  22.75 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  29.12 
 
 		 600 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  34.43 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  39.53 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  34.59 
 
 		 485 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  39.53 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  39.53 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  39.53 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 564 aa  60.5  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  39.53 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  39.53 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  25.53 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  25.53 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  25.53 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  25.53 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  31.18 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  31.43 
 
 		 538 aa  60.1  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  34.51 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  34.53 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  45.83 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  26.88 
 
 		 618 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  31.34 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  32.08 
 
 		 602 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  51.72 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  46.58 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 739 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  42.53 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>