96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2327 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 
539 aa  1010    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
546 aa  166  9e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  34.32 
 
 
543 aa  166  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  32.22 
 
 
536 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  31.71 
 
 
557 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  31.99 
 
 
566 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  29.81 
 
 
534 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.6 
 
 
523 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  31.05 
 
 
542 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  31.05 
 
 
542 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  31.05 
 
 
542 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  30.2 
 
 
575 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
535 aa  126  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  29.66 
 
 
532 aa  124  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.3 
 
 
596 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
586 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  36.65 
 
 
547 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  22.04 
 
 
555 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  39.49 
 
 
536 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  45.4 
 
 
523 aa  96.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  28.57 
 
 
537 aa  96.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  24.3 
 
 
542 aa  87.8  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  35.48 
 
 
530 aa  86.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  29.91 
 
 
558 aa  85.1  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  41.61 
 
 
500 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.3 
 
 
509 aa  75.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  38.46 
 
 
549 aa  74.7  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  25.86 
 
 
538 aa  70.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
537 aa  70.5  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
553 aa  70.1  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  21.2 
 
 
562 aa  67.8  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  27.97 
 
 
520 aa  66.6  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  36.75 
 
 
519 aa  65.1  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  26.94 
 
 
518 aa  64.3  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.74 
 
 
480 aa  64.3  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  25.68 
 
 
558 aa  63.9  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  34.38 
 
 
236 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  27.5 
 
 
525 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
235 aa  63.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 
582 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
502 aa  63.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
524 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.64 
 
 
533 aa  62  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  23.42 
 
 
478 aa  60.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  28.91 
 
 
510 aa  60.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  28.49 
 
 
500 aa  54.7  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.18 
 
 
492 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.18 
 
 
492 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  25.18 
 
 
502 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  27.79 
 
 
481 aa  53.5  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  34.15 
 
 
504 aa  53.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  27.67 
 
 
410 aa  53.5  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  45.16 
 
 
460 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  34.59 
 
 
505 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.75 
 
 
410 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
429 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.08 
 
 
459 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
429 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  28.75 
 
 
410 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.75 
 
 
410 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
429 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  25.09 
 
 
609 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  29.37 
 
 
598 aa  51.2  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  27.15 
 
 
425 aa  51.2  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  27.31 
 
 
616 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  36.78 
 
 
418 aa  50.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  33.68 
 
 
525 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
549 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  32.94 
 
 
739 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
517 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.12 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  28.12 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.91 
 
 
501 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  28.12 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.55 
 
 
601 aa  49.3  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
563 aa  48.9  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  37.93 
 
 
740 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  43.06 
 
 
399 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  26.64 
 
 
585 aa  48.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  30.23 
 
 
522 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  32.11 
 
 
454 aa  47  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  32.85 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.85 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  37.29 
 
 
493 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  30.34 
 
 
619 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  26.97 
 
 
618 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.11 
 
 
445 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  46.67 
 
 
485 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  39.47 
 
 
543 aa  45.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4118  putative transcriptional regulator, PucR family  39.44 
 
 
498 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244504  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  25.17 
 
 
486 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  29.6 
 
 
515 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  23.62 
 
 
494 aa  45.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  33.65 
 
 
429 aa  44.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  40.91 
 
 
505 aa  43.9  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>