118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0566 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 532 aa  1032    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  47.87 
 
 		 542 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 542 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 542 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  45.01 
 
 		 523 aa  364  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.66 
 
 		 533 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  38.22 
 
 		 536 aa  277  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  36.04 
 
 		 534 aa  269  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 535 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  36.53 
 
 		 566 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  38.79 
 
 		 575 aa  246  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  37.14 
 
 		 547 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.92 
 
 		 596 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 586 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  36.9 
 
 		 536 aa  218  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 546 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  35.77 
 
 		 523 aa  171  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.52 
 
 		 509 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  31.11 
 
 		 543 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  28.81 
 
 		 557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  23.1 
 
 		 558 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  39.29 
 
 		 549 aa  88.2  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 502 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 537 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  25.77 
 
 		 538 aa  79.7  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  35.25 
 
 		 530 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  37.68 
 
 		 500 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  32.46 
 
 		 542 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  36.43 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  34.11 
 
 		 485 aa  73.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  36.69 
 
 		 582 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  30.97 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  32.78 
 
 		 614 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  28.49 
 
 		 555 aa  67  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  29.86 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  30.43 
 
 		 645 aa  65.1  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  30.77 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  43.01 
 
 		 519 aa  60.8  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 516 aa  60.5  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  26.58 
 
 		 609 aa  60.1  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 514 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 563 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.55 
 
 		 501 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  36.08 
 
 		 739 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  39.53 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  28.49 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  26.44 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  24.95 
 
 		 520 aa  57  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  29.46 
 
 		 558 aa  57  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  30.97 
 
 		 520 aa  56.6  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  38.71 
 
 		 637 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.93 
 
 		 492 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.93 
 
 		 492 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  26.32 
 
 		 478 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  25.74 
 
 		 619 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  29.85 
 
 		 515 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  29.51 
 
 		 665 aa  54.7  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  35.29 
 
 		 543 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  27.42 
 
 		 512 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 403 aa  52.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 305 aa  52  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  38.1 
 
 		 504 aa  52  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  30.86 
 
 		 500 aa  52  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  25.25 
 
 		 600 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.28 
 
 		 480 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  28.3 
 
 		 627 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  31.29 
 
 		 616 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  31.97 
 
 		 648 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  25.27 
 
 		 525 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  29.92 
 
 		 412 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.92 
 
 		 412 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  36.47 
 
 		 644 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  42.42 
 
 		 561 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  26.36 
 
 		 483 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  23.58 
 
 		 585 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  28.69 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  31.29 
 
 		 403 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  31.08 
 
 		 502 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 515 aa  48.5  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 416 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 412 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  28.57 
 
 		 518 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  28.1 
 
 		 486 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.08 
 
 		 445 aa  48.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  28.04 
 
 		 414 aa  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  32.87 
 
 		 535 aa  47.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  37.84 
 
 		 639 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.43 
 
 		 459 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 517 aa  47.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 494 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  22.14 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  28.83 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  22.22 
 
 		 399 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  25.99 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>