98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0407 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 520 aa  1071    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  35.46 
 
 		 538 aa  87  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.25 
 
 		 601 aa  86.7  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 515 aa  84  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 537 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  31.79 
 
 		 585 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  35.51 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  25.67 
 
 		 609 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 553 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  20.35 
 
 		 562 aa  70.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  29.17 
 
 		 555 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  20.55 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  23.33 
 
 		 534 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  31.67 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  30.83 
 
 		 504 aa  63.9  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  22.12 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  19.18 
 
 		 542 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  30.97 
 
 		 532 aa  56.6  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  26.92 
 
 		 575 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.78 
 
 		 379 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  21.73 
 
 		 505 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 552 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  27.7 
 
 		 536 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  26.92 
 
 		 399 aa  56.2  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.07 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.07 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  34.07 
 
 		 502 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  27.68 
 
 		 536 aa  53.9  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  27.38 
 
 		 408 aa  53.9  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  27.46 
 
 		 665 aa  53.5  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  24.69 
 
 		 739 aa  53.5  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  27.69 
 
 		 399 aa  53.5  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2770  transcriptional regulator, CdaR  26.28 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0333515  hitchhiker  0.000000603935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1573  transcriptional regulator, CdaR  26.28 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1607  transcriptional regulator, CdaR  25.37 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 516 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  27.63 
 
 		 486 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 552 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2516  CdaR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.882452  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2584  CdaR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 410 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2682  CdaR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250773 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 546 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  26.9 
 
 		 566 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1473  transcriptional regulator, CdaR  26.49 
 
 		 413 aa  51.2  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  24 
 
 		 438 aa  50.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  26.06 
 
 		 518 aa  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  20.86 
 
 		 494 aa  50.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1774  putative sugar diacid utilization regulator  25 
 
 		 407 aa  50.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  22.22 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  32.08 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  25.86 
 
 		 236 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  25 
 
 		 407 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  26.09 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  22.77 
 
 		 525 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  23.08 
 
 		 740 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  28.66 
 
 		 400 aa  48.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 393 aa  48.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  25.95 
 
 		 382 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  32.65 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  26.88 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  24.35 
 
 		 557 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  30.63 
 
 		 549 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  27.01 
 
 		 385 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  24.14 
 
 		 558 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 586 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  23.72 
 
 		 547 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3621  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  26.17 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2528  transcriptional regulator, CdaR  24.03 
 
 		 387 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 514 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.43 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  24.85 
 
 		 543 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  28.17 
 
 		 648 aa  45.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 535 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  27.43 
 
 		 485 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  28.67 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  25.76 
 
 		 383 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  23.81 
 
 		 535 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.66 
 
 		 385 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.66 
 
 		 385 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.66 
 
 		 385 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.66 
 
 		 385 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.66 
 
 		 385 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  24.82 
 
 		 554 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  25.74 
 
 		 637 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  25.35 
 
 		 647 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  29.37 
 
 		 650 aa  44.3  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  26.9 
 
 		 537 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28 
 
 		 385 aa  44.3  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  19.23 
 
 		 359 aa  44.3  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  36.07 
 
 		 460 aa  43.9  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 659 aa  43.5  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  25.78 
 
 		 618 aa  43.5  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  28.66 
 
 		 385 aa  43.5  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  28.66 
 
 		 385 aa  43.5  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>