112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2065 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 549 aa  1032    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.42 
 
 		 509 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  32.96 
 
 		 500 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 524 aa  123  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.77 
 
 		 596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  46.56 
 
 		 582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  37.7 
 
 		 557 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  27.98 
 
 		 532 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 546 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  30.57 
 
 		 543 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 586 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  38.33 
 
 		 558 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  26.92 
 
 		 534 aa  97.8  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.09 
 
 		 523 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  34.59 
 
 		 536 aa  92.8  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 535 aa  90.9  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  34.18 
 
 		 547 aa  89  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 516 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.64 
 
 		 533 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  32.19 
 
 		 542 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 542 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 542 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  34.62 
 
 		 566 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  40.54 
 
 		 536 aa  81.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  44.44 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  24.61 
 
 		 558 aa  75.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  33.93 
 
 		 542 aa  75.5  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  37.4 
 
 		 500 aa  74.3  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  38.46 
 
 		 539 aa  74.3  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  32.58 
 
 		 575 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  39.45 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  32.57 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  36.3 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 		 523 aa  70.1  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  31.48 
 
 		 537 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  38.54 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.54 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  31.74 
 
 		 530 aa  67  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 553 aa  66.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  42.2 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  32 
 
 		 520 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.96 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  34.23 
 
 		 236 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.87 
 
 		 501 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  30.18 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  38.38 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  40.4 
 
 		 598 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  29.96 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 563 aa  58.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  25.6 
 
 		 555 aa  57  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.57 
 
 		 480 aa  57  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 305 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  18.41 
 
 		 562 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  36.97 
 
 		 535 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 564 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  28.18 
 
 		 505 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 517 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  42.25 
 
 		 502 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.25 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.25 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  23.2 
 
 		 407 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  27.04 
 
 		 487 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.07 
 
 		 459 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  32.05 
 
 		 425 aa  52  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  34.69 
 
 		 531 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 403 aa  51.6  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4484  putative transcriptional regulator, PucR family  54.39 
 
 		 365 aa  50.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.402234  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  30.25 
 
 		 555 aa  50.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  41.75 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  32.71 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  48.33 
 
 		 517 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 552 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  34.95 
 
 		 512 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  43.75 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  26.29 
 
 		 609 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  44.26 
 
 		 647 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 549 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  42.19 
 
 		 645 aa  48.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  39.39 
 
 		 519 aa  47.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  34.48 
 
 		 389 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  39.39 
 
 		 639 aa  47.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 405 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  36.47 
 
 		 627 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 405 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  26.27 
 
 		 543 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  40.62 
 
 		 637 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  37.33 
 
 		 403 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1423  putative transcriptional regulator, PucR family  54.55 
 
 		 374 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.77 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  34 
 
 		 597 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  35.37 
 
 		 665 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>