224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1854 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  100 
 
 		 501 aa  968    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  31.67 
 
 		 519 aa  189  9e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  32.53 
 
 		 504 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  33.74 
 
 		 481 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  35.9 
 
 		 502 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  35.34 
 
 		 485 aa  170  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  34.17 
 
 		 483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 502 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  32.38 
 
 		 486 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 517 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  32.21 
 
 		 491 aa  137  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  35.38 
 
 		 598 aa  126  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  30.06 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 516 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  30.04 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  32.67 
 
 		 558 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  28.19 
 
 		 515 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  31.16 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 553 aa  106  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  27.13 
 
 		 502 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.27 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  24.8 
 
 		 512 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.29 
 
 		 486 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  28.57 
 
 		 528 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.01 
 
 		 480 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  28.19 
 
 		 505 aa  94.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  40.43 
 
 		 487 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.15 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  29.58 
 
 		 514 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  29.96 
 
 		 492 aa  91.3  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  25.35 
 
 		 493 aa  90.1  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  35.29 
 
 		 566 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  26.68 
 
 		 555 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.83 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  35 
 
 		 536 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 586 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  35.26 
 
 		 547 aa  80.1  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  42.2 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  38.52 
 
 		 531 aa  77.8  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  22.46 
 
 		 555 aa  77  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  27.15 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  27.48 
 
 		 525 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.33 
 
 		 596 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 537 aa  74.7  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  29.89 
 
 		 536 aa  74.7  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  25.37 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.13 
 
 		 565 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  33.12 
 
 		 575 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 546 aa  71.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  38.24 
 
 		 582 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  25 
 
 		 537 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  22.33 
 
 		 740 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  34.07 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.07 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  32.28 
 
 		 549 aa  68.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  30.69 
 
 		 543 aa  67.4  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  30.6 
 
 		 542 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 542 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 542 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  32.35 
 
 		 365 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  32.69 
 
 		 557 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  32.86 
 
 		 534 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 549 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  29.55 
 
 		 532 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  26.78 
 
 		 538 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 563 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  30.36 
 
 		 609 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 564 aa  64.7  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  41.41 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  23.12 
 
 		 562 aa  63.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  21.25 
 
 		 542 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  37.86 
 
 		 518 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.57 
 
 		 509 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  24.44 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  23.54 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  36.9 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  31.78 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 524 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  21.44 
 
 		 739 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  40.91 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  44.87 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  25.63 
 
 		 618 aa  58.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  43.84 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  29.91 
 
 		 539 aa  57.4  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 514 aa  57  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 403 aa  56.6  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 535 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  51.52 
 
 		 500 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  24.16 
 
 		 520 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  42.47 
 
 		 520 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  22.49 
 
 		 515 aa  55.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  34.96 
 
 		 543 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>