88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0338 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 542 aa  1046    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  100 
 
 		 542 aa  1046    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 542 aa  1046    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  67.12 
 
 		 523 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  64.04 
 
 		 533 aa  587  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  47.87 
 
 		 532 aa  388  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  41.86 
 
 		 536 aa  316  8e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  39.31 
 
 		 534 aa  296  7e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.18 
 
 		 596 aa  292  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  41.13 
 
 		 566 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 586 aa  281  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 546 aa  268  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 535 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  39.72 
 
 		 547 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  39.21 
 
 		 575 aa  256  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  39.31 
 
 		 536 aa  244  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  37.48 
 
 		 523 aa  210  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 543 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  29.66 
 
 		 557 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  31.14 
 
 		 530 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.85 
 
 		 509 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  25.61 
 
 		 558 aa  89  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 524 aa  84  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  21.31 
 
 		 537 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  32.18 
 
 		 549 aa  82  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  34.48 
 
 		 558 aa  79.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  25.77 
 
 		 519 aa  79  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  34.68 
 
 		 485 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  33.12 
 
 		 598 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 235 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  24.44 
 
 		 542 aa  70.9  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.47 
 
 		 480 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  37.01 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  32.58 
 
 		 582 aa  67  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  36.11 
 
 		 478 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  20.86 
 
 		 553 aa  66.6  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 502 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  34.46 
 
 		 539 aa  63.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  33.33 
 
 		 486 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  29.2 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.46 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  24.86 
 
 		 500 aa  59.7  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.41 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.6 
 
 		 501 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  28.62 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  35.4 
 
 		 515 aa  57  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  28.91 
 
 		 491 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  30.07 
 
 		 410 aa  55.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  33.69 
 
 		 502 aa  55.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  25.38 
 
 		 520 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  34.41 
 
 		 535 aa  54.3  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  28.17 
 
 		 410 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  26.79 
 
 		 502 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.17 
 
 		 410 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  28.17 
 
 		 410 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 516 aa  53.5  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  28.87 
 
 		 481 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  24.02 
 
 		 585 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  28.17 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.17 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.17 
 
 		 410 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  26.69 
 
 		 618 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  18.49 
 
 		 562 aa  51.2  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  28.47 
 
 		 518 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  26.71 
 
 		 510 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  22.67 
 
 		 512 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  34.09 
 
 		 412 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.09 
 
 		 412 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 412 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  31.68 
 
 		 389 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 405 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 312 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 405 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.03 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  34.41 
 
 		 531 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 494 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.09 
 
 		 492 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.09 
 
 		 492 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  31.13 
 
 		 454 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  34.02 
 
 		 543 aa  44.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 383 aa  44.3  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  29 
 
 		 425 aa  43.5  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>