132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7828 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 483 aa  936    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  40.94 
 
 		 485 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  40.16 
 
 		 481 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  38.97 
 
 		 486 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  41.02 
 
 		 502 aa  213  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 502 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  34.66 
 
 		 535 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  40.33 
 
 		 598 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.17 
 
 		 501 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  29.69 
 
 		 519 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  29.72 
 
 		 555 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  44.68 
 
 		 558 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  39.65 
 
 		 491 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  35.21 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  45.24 
 
 		 456 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  28.63 
 
 		 504 aa  103  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  43.42 
 
 		 478 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.81 
 
 		 565 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  48.6 
 
 		 480 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 517 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.46 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  42.98 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  33.93 
 
 		 502 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 516 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  26.7 
 
 		 505 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 586 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.19 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.19 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.26 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 546 aa  74.7  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.26 
 
 		 596 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  29.96 
 
 		 543 aa  73.6  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  26.43 
 
 		 537 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  38.66 
 
 		 536 aa  72.4  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  35.05 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  27.01 
 
 		 542 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  31.05 
 
 		 528 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  36.18 
 
 		 575 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  38.89 
 
 		 547 aa  70.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  33.83 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  36.97 
 
 		 566 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  36 
 
 		 558 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  41.84 
 
 		 536 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  35.45 
 
 		 557 aa  67  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  25.67 
 
 		 515 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  33.58 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 535 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  34.23 
 
 		 534 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  37.38 
 
 		 582 aa  64.3  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  38.38 
 
 		 549 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  34.86 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  29.2 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  42.71 
 
 		 501 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  37.01 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.31 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  30.65 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  35.42 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  35.79 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.79 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  34.38 
 
 		 512 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  32.17 
 
 		 740 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 514 aa  53.5  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 305 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 563 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  21.69 
 
 		 562 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3177  CdaR transcriptional regulator  32.77 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2909  CdaR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2539  transcriptional regulator, CdaR  32.77 
 
 		 365 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  45.88 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  41.05 
 
 		 561 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  31.22 
 
 		 520 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  28.35 
 
 		 609 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2691  transcriptional regulator, CdaR  34.55 
 
 		 365 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.41 
 
 		 523 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  33.09 
 
 		 525 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  36.59 
 
 		 547 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  28.38 
 
 		 555 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 		 665 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  32.65 
 
 		 562 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  36.9 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  26.36 
 
 		 532 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  28.78 
 
 		 739 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  40.48 
 
 		 514 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  23.48 
 
 		 399 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.1 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2673  transcriptional regulator, CdaR  32.69 
 
 		 365 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0615728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  25.78 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  38.94 
 
 		 523 aa  48.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  23.48 
 
 		 399 aa  47.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 235 aa  47.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  37.04 
 
 		 525 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 492 aa  47.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>