142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7095 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 575 aa  1118    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  59.67 
 
 		 536 aa  551  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  59.08 
 
 		 566 aa  531  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  53.95 
 
 		 596 aa  529  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  53.41 
 
 		 534 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  54.03 
 
 		 586 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  56.17 
 
 		 546 aa  497  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  55.96 
 
 		 547 aa  481  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  53.04 
 
 		 536 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  38.79 
 
 		 532 aa  273  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  39.67 
 
 		 542 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 542 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 542 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.29 
 
 		 523 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 535 aa  251  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.11 
 
 		 533 aa  224  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4079  transcriptional regulator, PucR family  36.1 
 
 		 523 aa  167  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  31.08 
 
 		 557 aa  160  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  34.34 
 
 		 543 aa  158  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4239  transcriptional regulator, PucR family  31.1 
 
 		 530 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  22.24 
 
 		 542 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 524 aa  126  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  22.32 
 
 		 537 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  26.43 
 
 		 558 aa  107  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  22.66 
 
 		 555 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  36.21 
 
 		 539 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 537 aa  100  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  29 
 
 		 520 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  29.39 
 
 		 504 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  31.76 
 
 		 500 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  25.5 
 
 		 538 aa  86.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  35.1 
 
 		 558 aa  84.3  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  32.16 
 
 		 609 aa  84  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  27.39 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.83 
 
 		 601 aa  83.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 516 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.43 
 
 		 480 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  33.14 
 
 		 236 aa  75.1  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.89 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  20.73 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  34.57 
 
 		 485 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  34.46 
 
 		 549 aa  71.6  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  36.18 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  30.57 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 235 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.62 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  27.87 
 
 		 740 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  31.29 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  32.45 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  35.04 
 
 		 518 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  31.76 
 
 		 582 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  31.06 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  29.67 
 
 		 598 aa  65.1  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  24.76 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.77 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  26.19 
 
 		 502 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 552 aa  63.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  39.56 
 
 		 637 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  31.29 
 
 		 535 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.03 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  29.45 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  26.03 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  33.61 
 
 		 389 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.83 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  32.76 
 
 		 454 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.83 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  39.24 
 
 		 627 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  35.85 
 
 		 512 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  30.9 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  33.66 
 
 		 616 aa  58.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  34.48 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  38.37 
 
 		 619 aa  58.2  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 549 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0407  transcriptional regulator, CdaR  26.92 
 
 		 520 aa  57  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  37.36 
 
 		 645 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  22.33 
 
 		 493 aa  56.6  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  38.95 
 
 		 665 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  35.37 
 
 		 502 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  30.67 
 
 		 618 aa  55.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  30.08 
 
 		 410 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  30.08 
 
 		 410 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  30.08 
 
 		 410 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  31.07 
 
 		 543 aa  53.9  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  29.66 
 
 		 531 aa  53.9  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  30.08 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  30.08 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  30.08 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  29.85 
 
 		 379 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 515 aa  52.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>