More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2223 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 520 aa  1008    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  44.47 
 
 		 501 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  39.37 
 
 		 505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  38.31 
 
 		 514 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 552 aa  266  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  39.37 
 
 		 515 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  37 
 
 		 543 aa  236  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  35.24 
 
 		 486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  58.27 
 
 		 561 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  29.21 
 
 		 504 aa  93.2  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  44.35 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 553 aa  83.2  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  39.33 
 
 		 517 aa  80.5  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  37.59 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  46.34 
 
 		 525 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  36.45 
 
 		 558 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  46.34 
 
 		 525 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  35.33 
 
 		 536 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  40.16 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 558 aa  73.6  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  31.52 
 
 		 518 aa  73.6  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.75 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  37.86 
 
 		 705 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  36.36 
 
 		 478 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  41.67 
 
 		 535 aa  72  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  30.53 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  44 
 
 		 486 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.83 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  30.65 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  33.7 
 
 		 485 aa  70.1  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 429 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 429 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0545  transcriptional regulator, CdaR  36.97 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 429 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  30.28 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.68 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  30 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  22.75 
 
 		 740 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  38.95 
 
 		 412 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  38.95 
 
 		 412 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  34.97 
 
 		 562 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  29.2 
 
 		 411 aa  67  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 564 aa  66.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  35.11 
 
 		 371 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 412 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  35.23 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  25.91 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  31.03 
 
 		 536 aa  63.9  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  40 
 
 		 602 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  30.61 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 659 aa  63.9  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  36.99 
 
 		 382 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  45.83 
 
 		 547 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  28.34 
 
 		 410 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 517 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  22.16 
 
 		 555 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  36.17 
 
 		 609 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  28.34 
 
 		 410 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.34 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.34 
 
 		 410 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  50.72 
 
 		 502 aa  62.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  28.34 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  44.44 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.34 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  42.5 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  28.34 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  27.57 
 
 		 616 aa  61.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  29.41 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50790  hypothetical protein  38.66 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937212  hitchhiker  0.00694417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 524 aa  61.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  34.57 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  38.2 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  35.71 
 
 		 519 aa  60.1  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  34.94 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  47.95 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.83 
 
 		 565 aa  60.5  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  54.24 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  38.75 
 
 		 619 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  39.73 
 
 		 637 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  32.98 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  40.26 
 
 		 543 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  38.61 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  35.65 
 
 		 600 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  29.67 
 
 		 566 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  31.43 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  37.11 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  40.43 
 
 		 644 aa  58.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  29.17 
 
 		 582 aa  57.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  32.98 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  36.51 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  20.74 
 
 		 537 aa  57.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  27.42 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  39.08 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1473  transcriptional regulator, CdaR  37.7 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>