64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1107 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  64.07 
 
 		 555 aa  664    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  100 
 
 		 565 aa  1117    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  31.68 
 
 		 535 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  28.79 
 
 		 483 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  30.92 
 
 		 481 aa  123  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 531 aa  103  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  37.81 
 
 		 486 aa  97.4  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  26.41 
 
 		 505 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.75 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  32.53 
 
 		 598 aa  85.1  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  37.82 
 
 		 558 aa  83.2  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  35.48 
 
 		 502 aa  70.5  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  41.51 
 
 		 543 aa  68.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  26.61 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 517 aa  67.8  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  41.3 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  41.3 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 549 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  35.75 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  23.15 
 
 		 558 aa  63.9  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  34.07 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  32.26 
 
 		 487 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 412 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.67 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.85 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  43.75 
 
 		 485 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.54 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  30.71 
 
 		 504 aa  57  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  29.81 
 
 		 491 aa  56.2  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2909  CdaR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 374 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  30 
 
 		 582 aa  50.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.59 
 
 		 509 aa  50.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 235 aa  50.4  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  34.44 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2691  transcriptional regulator, CdaR  31.65 
 
 		 365 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 586 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  38.46 
 
 		 486 aa  48.9  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  30.83 
 
 		 520 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 552 aa  48.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3177  CdaR transcriptional regulator  30.65 
 
 		 389 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.48 
 
 		 596 aa  48.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2539  transcriptional regulator, CdaR  30.65 
 
 		 365 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03504  sugar diacide regulator  34.57 
 
 		 168 aa  48.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 524 aa  48.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2673  transcriptional regulator, CdaR  30.65 
 
 		 365 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0615728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  22.22 
 
 		 537 aa  47.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  35.56 
 
 		 400 aa  47.4  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  35.82 
 
 		 561 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  26.03 
 
 		 542 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  34.78 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  34.62 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  36.08 
 
 		 549 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  37.86 
 
 		 536 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43380  carbohydrate diacid transcriptional regulator  30.3 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251481  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  31.08 
 
 		 515 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  31.08 
 
 		 515 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  31.08 
 
 		 515 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 552 aa  45.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.41 
 
 		 486 aa  44.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  29.84 
 
 		 536 aa  44.3  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  30.63 
 
 		 566 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  34.52 
 
 		 517 aa  43.9  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>