189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1722 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 502 aa  929    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  47.02 
 
 		 485 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 502 aa  299  9e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  42.8 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  43.74 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  41.21 
 
 		 483 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  50.71 
 
 		 598 aa  225  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.98 
 
 		 501 aa  195  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  35.08 
 
 		 504 aa  171  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  32.95 
 
 		 535 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  32.63 
 
 		 519 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 517 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  30.8 
 
 		 478 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  45.71 
 
 		 558 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  32.48 
 
 		 487 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1107  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.42 
 
 		 565 aa  123  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.54 
 
 		 486 aa  123  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  38.43 
 
 		 531 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 516 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  30.72 
 
 		 512 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  44.2 
 
 		 491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  40.61 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  28.99 
 
 		 534 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  27.81 
 
 		 515 aa  106  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  21.43 
 
 		 542 aa  99.8  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  28.96 
 
 		 505 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  27.12 
 
 		 543 aa  96.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  27.51 
 
 		 502 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  28.6 
 
 		 557 aa  91.3  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.31 
 
 		 492 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  29.16 
 
 		 575 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  30.6 
 
 		 547 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  36.42 
 
 		 566 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.8 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  44.83 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 553 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  36.18 
 
 		 542 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 542 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 542 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  21.99 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 586 aa  80.9  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  27.84 
 
 		 523 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.77 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  37.93 
 
 		 454 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 549 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  38.99 
 
 		 536 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  30.6 
 
 		 514 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  21.44 
 
 		 555 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 552 aa  77  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  43.56 
 
 		 582 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.76 
 
 		 596 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  42.96 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 558 aa  70.9  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  40.38 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  27.06 
 
 		 525 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  31.76 
 
 		 532 aa  68.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  48.05 
 
 		 501 aa  67.8  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0356  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.36 
 
 		 533 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  44.33 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 546 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0012  polyketide synthase expression regulator  30.41 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  47.44 
 
 		 520 aa  66.6  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  24.9 
 
 		 585 aa  65.1  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  38.24 
 
 		 549 aa  62  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  26.17 
 
 		 520 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  35.4 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  35.4 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  35 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  35.4 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  35.4 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  35.4 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  35.4 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  26.74 
 
 		 538 aa  60.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  31.52 
 
 		 528 aa  60.1  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 535 aa  60.5  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  29.27 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 563 aa  60.1  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  27.45 
 
 		 543 aa  60.1  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  33.56 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  33.99 
 
 		 409 aa  60.1  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  32 
 
 		 609 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  28.54 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.9 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  26.44 
 
 		 618 aa  58.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  34.62 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.62 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  37.66 
 
 		 555 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  49.15 
 
 		 561 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  24.57 
 
 		 525 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 405 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  20.64 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  38.83 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>