248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5376 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  100 
 
 		 429 aa  845    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  100 
 
 		 429 aa  845    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  100 
 
 		 429 aa  845    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  73.84 
 
 		 459 aa  627  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  68.93 
 
 		 454 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.23 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  43.9 
 
 		 412 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  43.9 
 
 		 412 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 412 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  37.19 
 
 		 478 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  35.75 
 
 		 535 aa  87.4  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  30.86 
 
 		 519 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.93 
 
 		 480 aa  83.2  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  36.08 
 
 		 558 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  30.56 
 
 		 485 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  44.09 
 
 		 531 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  43.93 
 
 		 543 aa  79.7  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  31.87 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  38.74 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 505 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 598 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 564 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 552 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  31.74 
 
 		 504 aa  73.2  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  30.46 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  37.29 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  32.99 
 
 		 502 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 486 aa  67  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  35.04 
 
 		 520 aa  66.6  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  31.13 
 
 		 575 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  39.66 
 
 		 514 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.33 
 
 		 596 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.98 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.32 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.98 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  22.08 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  30.3 
 
 		 536 aa  63.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 586 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  35.42 
 
 		 236 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 546 aa  61.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  31.96 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  51.61 
 
 		 665 aa  61.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1825  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.43 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969959 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  42.31 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  39.02 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  36.94 
 
 		 616 aa  59.7  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  40.48 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  28.75 
 
 		 566 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  34.09 
 
 		 705 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  34.21 
 
 		 536 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  37.8 
 
 		 525 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  40.22 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  34.92 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  33.94 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  30.53 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  34.33 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  46.77 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  47.69 
 
 		 637 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  34.02 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.77 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  20.67 
 
 		 542 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.67 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  29.89 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  49.18 
 
 		 429 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  36 
 
 		 644 aa  57  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  32.26 
 
 		 491 aa  57  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  35.9 
 
 		 456 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  43.42 
 
 		 529 aa  56.6  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  42.67 
 
 		 539 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  32.23 
 
 		 515 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2327  transcriptional regulator, CdaR  27.6 
 
 		 539 aa  56.6  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  27.03 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  47.62 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  40.79 
 
 		 515 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  42.19 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  40.79 
 
 		 515 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  40.79 
 
 		 515 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  37.8 
 
 		 557 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1184  transcriptional regulator, CdaR  33.93 
 
 		 555 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000481254 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  40.48 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.69 
 
 		 509 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  41.54 
 
 		 619 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 479 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  32.35 
 
 		 486 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  30.87 
 
 		 542 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 542 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 542 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  29.03 
 
 		 350 aa  53.5  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  48.15 
 
 		 408 aa  53.9  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  41.18 
 
 		 389 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 425 aa  53.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  40.91 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>