221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1045 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 
350 aa  690    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  32.15 
 
 
361 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  34.51 
 
 
362 aa  119  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  36.41 
 
 
364 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  30.21 
 
 
359 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  34.23 
 
 
385 aa  87.4  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.95 
 
 
385 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.5 
 
 
385 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.5 
 
 
385 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  23.75 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  23.75 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.5 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.75 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.5 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.95 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  35.81 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.26 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  23.75 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.5 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.75 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  35.81 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.33 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.47 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  31.84 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  27.91 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2339  hypothetical protein  35.26 
 
 
313 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2653  hypothetical protein  33.95 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  32.17 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  24.29 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3621  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  33.33 
 
 
384 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  34.35 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  29.84 
 
 
436 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  31.43 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  32.57 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  30.21 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  30.17 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  29.61 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0150  transcriptional regulator, CdaR  24 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  35.19 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  30.6 
 
 
520 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  30.17 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
564 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  29.61 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  29.61 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  29.61 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  29.61 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  25.68 
 
 
379 aa  63.5  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  31.47 
 
 
382 aa  63.2  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2100  fis-type helix-turn-helix domain protein  50.88 
 
 
287 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1898  fis-type helix-turn-helix domain-containing protein  51.85 
 
 
287 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0263443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1633  hypothetical protein  51.85 
 
 
287 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2528  transcriptional regulator, CdaR  22.22 
 
 
387 aa  60.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  22.27 
 
 
384 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0792  hypothetical protein  51.02 
 
 
364 aa  60.1  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.60027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2070  transcriptional regulator, CdaR  24.1 
 
 
469 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0622  putative transcriptional regulator, PucR family  37.84 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
553 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  35 
 
 
525 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  35 
 
 
525 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  28.65 
 
 
558 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
393 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  32.84 
 
 
740 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03504  sugar diacide regulator  22.86 
 
 
168 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1774  putative sugar diacid utilization regulator  21.21 
 
 
407 aa  57  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1607  transcriptional regulator, CdaR  30.89 
 
 
413 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2592  carbohydrate diacid regulator (sugar diacid regulator)  33.06 
 
 
381 aa  56.6  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  32.17 
 
 
518 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  41.27 
 
 
473 aa  56.2  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2516  CdaR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
410 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.882452  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2584  CdaR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
410 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2682  CdaR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
410 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.250773 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1425  putative transcriptional regulator, PucR family  40.62 
 
 
296 aa  55.8  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  30.66 
 
 
385 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2770  transcriptional regulator, CdaR  30.89 
 
 
413 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0333515  hitchhiker  0.000000603935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  18.77 
 
 
434 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1573  transcriptional regulator, CdaR  30.89 
 
 
413 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1640  putative transcriptional regulator  28.8 
 
 
488 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
532 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  25.95 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 
429 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  25.62 
 
 
518 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0265  putative carbohydrate diacid regulator  28.8 
 
 
483 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0175  carbohydrate diacid regulator  28.8 
 
 
488 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1473  transcriptional regulator, CdaR  31.71 
 
 
413 aa  55.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
408 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0203  carbohydrate diacid regulator  28.8 
 
 
402 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  27.85 
 
 
637 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  21.67 
 
 
405 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
429 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43380  carbohydrate diacid transcriptional regulator  25 
 
 
367 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251481  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
429 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
429 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5477  transcriptional regulator, CdaR  21.74 
 
 
377 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  decreased coverage  0.00742174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  26.67 
 
 
739 aa  52.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2140  putative transcriptional regulator, PucR family  48.84 
 
 
411 aa  52.8  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  32.76 
 
 
705 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
403 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  20.23 
 
 
400 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>