91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1425 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1425  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 296 aa  604  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0622  putative transcriptional regulator, PucR family  51.19 
 
 		 300 aa  322  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2100  fis-type helix-turn-helix domain protein  33.11 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1898  fis-type helix-turn-helix domain-containing protein  32.42 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0263443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1633  hypothetical protein  32.77 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  26.37 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  46.15 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2653  hypothetical protein  24.61 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2339  hypothetical protein  24.61 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  29.45 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  39.71 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  40 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1926  helix-turn-helix domain-containing protein  24.48 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  23.53 
 
 		 380 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  40.62 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  19.49 
 
 		 381 aa  53.9  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  34.82 
 
 		 558 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  29.37 
 
 		 436 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2592  carbohydrate diacid regulator (sugar diacid regulator)  23.42 
 
 		 381 aa  53.1  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  32.5 
 
 		 379 aa  53.1  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  23.13 
 
 		 413 aa  52.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  26.27 
 
 		 385 aa  52.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  26.27 
 
 		 385 aa  52.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.42 
 
 		 385 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3621  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  26.5 
 
 		 384 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  25.42 
 
 		 385 aa  50.8  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2140  putative transcriptional regulator, PucR family  51.22 
 
 		 411 aa  50.4  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  30.25 
 
 		 388 aa  50.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2110  transcriptional regulator, CdaR  25.55 
 
 		 386 aa  49.7  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  35.38 
 
 		 415 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  37.14 
 
 		 371 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2528  transcriptional regulator, CdaR  27.27 
 
 		 387 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  52.63 
 
 		 518 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 553 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  22.7 
 
 		 383 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  37.29 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  29.13 
 
 		 528 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  37.29 
 
 		 505 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  27.27 
 
 		 400 aa  46.6  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.76 
 
 		 459 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  35.59 
 
 		 371 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2197  transcriptional regulator, PucR family  34.52 
 
 		 540 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  26.04 
 
 		 520 aa  46.2  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  26.5 
 
 		 385 aa  46.2  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  37.25 
 
 		 609 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.73 
 
 		 376 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.73 
 
 		 385 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3130  transcriptional regulator, CdaR  46.15 
 
 		 382 aa  45.8  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  23.73 
 
 		 385 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  23.73 
 
 		 385 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  23.73 
 
 		 385 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0150  transcriptional regulator, CdaR  24.39 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0792  hypothetical protein  29.69 
 
 		 364 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.60027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.73 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  31.03 
 
 		 454 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.73 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.73 
 
 		 385 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  33.9 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.89 
 
 		 385 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1836  CdaR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  31.87 
 
 		 538 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  33.96 
 
 		 561 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  36.92 
 
 		 493 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.73 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.73 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.73 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.73 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  23.73 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.85 
 
 		 486 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  33.9 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  33.9 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 543 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  33.9 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  33.9 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  33.9 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.74 
 
 		 480 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 429 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 429 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 429 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 552 aa  42.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  34 
 
 		 739 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  37.25 
 
 		 512 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  26.45 
 
 		 413 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2428  putative transcriptional regulator, PucR family  30.43 
 
 		 563 aa  42.7  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 501 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  32.79 
 
 		 555 aa  42.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  34.38 
 
 		 558 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  30.77 
 
 		 518 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>