121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCZK1633 on replicon NC_006274
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006274  BCZK1633  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  588  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1898  fis-type helix-turn-helix domain-containing protein  99.3 
 
 
287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0263443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2100  fis-type helix-turn-helix domain protein  77.7 
 
 
287 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147633  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0622  putative transcriptional regulator, PucR family  38.64 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1425  putative transcriptional regulator, PucR family  32.77 
 
 
296 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1926  helix-turn-helix domain-containing protein  30.39 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  32.43 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  29.37 
 
 
436 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2653  hypothetical protein  50.82 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2339  hypothetical protein  50.82 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  33.33 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  34.04 
 
 
371 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06864  transcriptional regulator  35.79 
 
 
376 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  32.62 
 
 
371 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  51.85 
 
 
350 aa  63.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2908  transcriptional regulator, CdaR  34.75 
 
 
359 aa  62.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  30.5 
 
 
371 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3610  transcriptional regulator, CdaR  27.91 
 
 
362 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  29.79 
 
 
371 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  29.79 
 
 
371 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  29.79 
 
 
371 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  29.46 
 
 
380 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  30.5 
 
 
371 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  29.79 
 
 
371 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  29.01 
 
 
388 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  29.79 
 
 
371 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  24.82 
 
 
371 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2804  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  24 
 
 
385 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1043  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  24.67 
 
 
385 aa  57  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  27.84 
 
 
493 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0332  hypothetical protein  36 
 
 
379 aa  57  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  39.68 
 
 
381 aa  56.6  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  36.51 
 
 
558 aa  55.8  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1306  CdaR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
515 aa  55.8  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00277774  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0792  hypothetical protein  40.79 
 
 
364 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.60027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  27.1 
 
 
413 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1182  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  22.67 
 
 
385 aa  52.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 
510 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  25.86 
 
 
618 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3095  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  22.67 
 
 
385 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2640  transcriptional regulator, CdaR  24.84 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3547  CdaR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
532 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1836  CdaR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
384 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  26.67 
 
 
739 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  30.68 
 
 
505 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
552 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3621  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  33.82 
 
 
384 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  25.96 
 
 
392 aa  49.7  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  29.55 
 
 
515 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0231  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  22 
 
 
385 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.982671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0247  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  22 
 
 
385 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0233  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  22 
 
 
385 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0249  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  22 
 
 
385 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0230  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  22 
 
 
385 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  29.55 
 
 
492 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1518  transcriptional regulator, CdaR  35.38 
 
 
385 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  42 
 
 
518 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  28.41 
 
 
543 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3440  transcriptional regulator, CdaR  31.82 
 
 
385 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  35.14 
 
 
412 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.14 
 
 
412 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  32 
 
 
415 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
412 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0702  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.82 
 
 
385 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3497  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.82 
 
 
385 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  29 
 
 
528 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2140  putative transcriptional regulator, PucR family  46.51 
 
 
411 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.825102  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00161  DNA-binding transcriptional activator  31.82 
 
 
385 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0166  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.82 
 
 
385 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0167  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.82 
 
 
376 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0174  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.82 
 
 
385 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0172  carbohydrate diacid transcriptional activator CdaR  31.82 
 
 
385 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  30.38 
 
 
555 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00160  hypothetical protein  31.82 
 
 
385 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  32.31 
 
 
705 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  22.71 
 
 
553 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0874  regulator of polyketide synthase expression  30.16 
 
 
223 aa  46.2  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  27.84 
 
 
609 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2073  transcriptional regulator, PucR family  24.71 
 
 
517 aa  46.2  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  36.21 
 
 
525 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  36.21 
 
 
525 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2703  transcriptional regulator, CdaR  33.82 
 
 
383 aa  45.8  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.601624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  28.09 
 
 
514 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  26.14 
 
 
501 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  30.36 
 
 
430 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
408 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  31.34 
 
 
407 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  34.04 
 
 
412 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  28.12 
 
 
561 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2909  CdaR family transcriptional regulator  21.38 
 
 
374 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
393 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
390 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  29.73 
 
 
384 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  30.38 
 
 
438 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  30.77 
 
 
538 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
410 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  29.55 
 
 
486 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2592  carbohydrate diacid regulator (sugar diacid regulator)  36.21 
 
 
381 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  32.43 
 
 
404 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>