63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4621 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  873    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2857  putative transcriptional regulator, PucR family  40.83 
 
 		 421 aa  248  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26290  regulator of polyketide synthase expression  32.67 
 
 		 441 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  28.67 
 
 		 422 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  27.37 
 
 		 408 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6844  putative regulator of polyketide synthase expression  29.15 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222986  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3869  putative transcriptional regulator, PucR family  25.59 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155401  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4444  putative transcriptional regulator, PucR family  35.25 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2881  putative transcriptional regulator, PucR family  28.52 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11481  transcriptional activator protein  24.21 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.48079e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2815  hypothetical protein  26.91 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.129951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  27.84 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  36.17 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11218  hypothetical protein  24.85 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4213  hypothetical protein  26.32 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  31.33 
 
 		 492 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  37.25 
 
 		 438 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 381 aa  54.7  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  32.5 
 
 		 510 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  34.4 
 
 		 514 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6547  CdaR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  27.49 
 
 		 418 aa  53.5  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12395  hypothetical protein  24.64 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.537746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2359  putative transcriptional regulator, PucR family  26.44 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  26.89 
 
 		 518 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  34.29 
 
 		 371 aa  50.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  30.23 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 379 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  25.5 
 
 		 525 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  24.07 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2100  fis-type helix-turn-helix domain protein  29.58 
 
 		 287 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147633  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2592  carbohydrate diacid regulator (sugar diacid regulator)  28.12 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  37.14 
 
 		 426 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  23.55 
 
 		 398 aa  47  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  48.98 
 
 		 531 aa  46.6  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  35.71 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1898  fis-type helix-turn-helix domain-containing protein  30.36 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0263443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1633  hypothetical protein  30.36 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  38.24 
 
 		 618 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  38.81 
 
 		 535 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  27.5 
 
 		 619 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  38.57 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  36.23 
 
 		 276 aa  44.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 552 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 558 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  33.72 
 
 		 585 aa  44.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  33.62 
 
 		 456 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 305 aa  44.3  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  24.37 
 
 		 562 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  36.92 
 
 		 392 aa  43.5  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 552 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 371 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  28.36 
 
 		 414 aa  43.5  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  28.42 
 
 		 371 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  28.42 
 
 		 371 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 371 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  32.38 
 
 		 371 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  32 
 
 		 501 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  28.19 
 
 		 740 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  27.19 
 
 		 436 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>