36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2359 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2359  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 438 aa  852    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3869  putative transcriptional regulator, PucR family  56.13 
 
 		 405 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155401  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2881  putative transcriptional regulator, PucR family  50.35 
 
 		 406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11218  hypothetical protein  46.73 
 
 		 421 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12395  hypothetical protein  45.67 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.537746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11481  transcriptional activator protein  44.81 
 
 		 432 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.48079e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6844  putative regulator of polyketide synthase expression  40.96 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222986  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2815  hypothetical protein  38.35 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.129951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4444  putative transcriptional regulator, PucR family  29.65 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26290  regulator of polyketide synthase expression  31.46 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  27.17 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4621  hypothetical protein  26.19 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  32.36 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  27.7 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  35.51 
 
 		 425 aa  50.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  34.95 
 
 		 399 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4213  hypothetical protein  27.13 
 
 		 405 aa  50.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  36.47 
 
 		 558 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  33.64 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.62 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.62 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.62 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  41.67 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  27.1 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  37.93 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  32.14 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 564 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2857  putative transcriptional regulator, PucR family  27.08 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 405 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  32.56 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>