171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0764 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 311 aa  632  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  57.56 
 
 		 425 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  50.18 
 
 		 410 aa  255  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  49.45 
 
 		 410 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  49.45 
 
 		 410 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  49.45 
 
 		 410 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  49.45 
 
 		 410 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  49.45 
 
 		 410 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  49.45 
 
 		 410 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 405 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  43.82 
 
 		 389 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  29.72 
 
 		 525 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  30.83 
 
 		 553 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  30.61 
 
 		 525 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  30.62 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  23.84 
 
 		 739 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  23.24 
 
 		 538 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  27.95 
 
 		 518 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  23.64 
 
 		 740 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  27.34 
 
 		 558 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  33.79 
 
 		 609 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  39.44 
 
 		 705 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  19.48 
 
 		 555 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 563 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  25.37 
 
 		 520 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  31.65 
 
 		 558 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  24.37 
 
 		 585 aa  63.2  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 553 aa  62.8  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  25 
 
 		 618 aa  62.4  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  31.89 
 
 		 637 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  36.43 
 
 		 515 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4149  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.88 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  22.86 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  23.99 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 659 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  33.85 
 
 		 616 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  27.75 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11458  hypothetical protein  30.77 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0377349 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  26.19 
 
 		 399 aa  55.8  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  38.37 
 
 		 418 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1742  transcriptional regulator, CdaR  29.27 
 
 		 520 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 597 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  26.91 
 
 		 647 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  25.53 
 
 		 648 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  25.08 
 
 		 438 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  26.72 
 
 		 562 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 494 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  25.4 
 
 		 399 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  28.89 
 
 		 518 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 390 aa  53.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  32.28 
 
 		 644 aa  53.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 524 aa  52.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.37 
 
 		 601 aa  52.8  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  38.3 
 
 		 405 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  28.06 
 
 		 616 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  29.36 
 
 		 611 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 410 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  26.95 
 
 		 741 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 502 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4043  putative transcriptional regulator, PucR family  33.86 
 
 		 504 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389127  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  45.07 
 
 		 500 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1861  CdaR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  28.93 
 
 		 505 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  31.86 
 
 		 639 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  38.46 
 
 		 519 aa  49.7  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1394  CdaR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 381 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  29.41 
 
 		 383 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2347  transcriptional regulator, CdaR  21.3 
 
 		 408 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00870953  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  26.09 
 
 		 353 aa  49.3  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  28.7 
 
 		 493 aa  49.7  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 564 aa  49.3  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  26.71 
 
 		 353 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  25.29 
 
 		 379 aa  49.3  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 477 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  30 
 
 		 413 aa  49.3  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  23.05 
 
 		 406 aa  49.3  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  31.58 
 
 		 412 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  32.33 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 535 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.58 
 
 		 412 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  27.27 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 412 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  41.27 
 
 		 514 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  36 
 
 		 485 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  30.19 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  27.4 
 
 		 515 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 514 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  29.03 
 
 		 512 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  42.11 
 
 		 411 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  37.18 
 
 		 543 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6844  putative regulator of polyketide synthase expression  37.8 
 
 		 394 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222986  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  36.47 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>