67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4043 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4043  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 504 aa  944    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389127  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 514 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0097  regulator of polyketide synthase expression-like  37.78 
 
 		 524 aa  69.7  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  43.1 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2943  putative PucR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 468 aa  62  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  39.73 
 
 		 510 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 553 aa  53.9  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  42.05 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 537 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 505 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  40.91 
 
 		 555 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  42.05 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  42.05 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  42.05 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 563 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  42.05 
 
 		 410 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  42.05 
 
 		 410 aa  52  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  42.05 
 
 		 410 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  46.58 
 
 		 393 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  35.22 
 
 		 442 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  33.6 
 
 		 389 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  33.86 
 
 		 311 aa  50.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  35.04 
 
 		 493 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 405 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13710  sugar diacid utilization regulator  36 
 
 		 393 aa  50.1  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 405 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  46.15 
 
 		 665 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1640  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 		 488 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  40.14 
 
 		 681 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0175  carbohydrate diacid regulator  36.42 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  38 
 
 		 552 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  32.75 
 
 		 553 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0265  putative carbohydrate diacid regulator  37.14 
 
 		 483 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18471  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  32.41 
 
 		 425 aa  49.3  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0087  CdaR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 383 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  39.68 
 
 		 456 aa  48.5  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  49.32 
 
 		 418 aa  48.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3648  hypothetical protein  46.88 
 
 		 510 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.694163  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  31.47 
 
 		 436 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  43.59 
 
 		 525 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  45.28 
 
 		 645 aa  47.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  52.63 
 
 		 414 aa  47.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  35.67 
 
 		 518 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  43.59 
 
 		 525 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 312 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  25.42 
 
 		 364 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  38.24 
 
 		 705 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  31.54 
 
 		 520 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  40.38 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0203  carbohydrate diacid regulator  41.11 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  44.16 
 
 		 535 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2592  carbohydrate diacid regulator (sugar diacid regulator)  29.75 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  43.08 
 
 		 460 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  34.94 
 
 		 501 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  40.91 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  45.21 
 
 		 648 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  34.78 
 
 		 536 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 408 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 403 aa  44.3  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 597 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4118  putative transcriptional regulator, PucR family  37.86 
 
 		 498 aa  44.3  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  45.71 
 
 		 540 aa  43.9  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  43.24 
 
 		 558 aa  43.9  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 494 aa  43.5  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  45.33 
 
 		 637 aa  43.5  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  31.85 
 
 		 739 aa  43.5  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>