137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3793 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 415 aa  820    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  48.49 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  42.36 
 
 		 416 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  44.39 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  42.13 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  44.5 
 
 		 399 aa  245  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  36.88 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  33.25 
 
 		 479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 464 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  36.43 
 
 		 447 aa  170  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  36.51 
 
 		 392 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  36.23 
 
 		 420 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  31.54 
 
 		 495 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  31.11 
 
 		 417 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  30.42 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  31.05 
 
 		 416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  30.19 
 
 		 419 aa  116  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  33.42 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  30.52 
 
 		 414 aa  106  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  29.02 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  26.51 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  26.75 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  30.66 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  38.85 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 552 aa  57.4  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  36.44 
 
 		 501 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  45.61 
 
 		 554 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  45.61 
 
 		 554 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  45.61 
 
 		 554 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  22.97 
 
 		 740 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  35 
 
 		 514 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  32.99 
 
 		 611 aa  53.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  28.24 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  35.56 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  31.88 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  33.53 
 
 		 498 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  42.47 
 
 		 529 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  23.61 
 
 		 739 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  45.76 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  39.8 
 
 		 525 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  32.26 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 537 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  23.94 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  29.61 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  36.99 
 
 		 601 aa  50.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  50.98 
 
 		 538 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  34.12 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  29.61 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 563 aa  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 502 aa  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  34.12 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.61 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.61 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  34.12 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  36.36 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  32.65 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.14 
 
 		 501 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  38.67 
 
 		 520 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  32.56 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  29.81 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  43.28 
 
 		 485 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  32.81 
 
 		 520 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  26.28 
 
 		 602 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.57 
 
 		 486 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  26.8 
 
 		 537 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  33.98 
 
 		 537 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  32.81 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  37.68 
 
 		 505 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  27.71 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  26.8 
 
 		 542 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 305 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 517 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  37.19 
 
 		 486 aa  47  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  31.25 
 
 		 558 aa  47  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  26.97 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  26.25 
 
 		 393 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 553 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  37.33 
 
 		 681 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 405 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  37.88 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  40.28 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  38.36 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  39.44 
 
 		 515 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  38.46 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  39.44 
 
 		 515 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  39.44 
 
 		 515 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  35.63 
 
 		 644 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 597 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  35.23 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4118  putative transcriptional regulator, PucR family  34.78 
 
 		 498 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  41.38 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  44.07 
 
 		 538 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>